Protein–RNA interactions for Protein: P53923

NCS2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCS2P53923 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.61■■□□□ 1.21
NCS2P53923 NSR1YGR159C 1245 nt22.38■■□□□ 1.17
NCS2P53923 NOP1YDL014W 984 nt22.02■■□□□ 1.12
NCS2P53923 YKL036CYKL036C 393 nt20.43■□□□□ 0.86
NCS2P53923 MDJ1YFL016C 1536 nt19.78■□□□□ 0.76
NCS2P53923 Q0297Q0297 156 nt19.32■□□□□ 0.68
NCS2P53923 SRX1YKL086W 384 nt19.25■□□□□ 0.67
NCS2P53923 YJL027CYJL027C 417 nt19.07■□□□□ 0.64
NCS2P53923 SCS3YGL126W 1143 nt18.64■□□□□ 0.57
NCS2P53923 YCR051WYCR051W 669 nt18.27■□□□□ 0.52
NCS2P53923 YOL085CYOL085C 342 nt17.69■□□□□ 0.42
NCS2P53923 DBP2YNL112W 1641 nt17.54■□□□□ 0.4
NCS2P53923 PKP1YIL042C 1185 nt17.41■□□□□ 0.38
NCS2P53923 RPP1BYDL130W 321 nt17.34■□□□□ 0.37
NCS2P53923 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.34■□□□□ 0.37
NCS2P53923 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.34■□□□□ 0.37
NCS2P53923 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.34■□□□□ 0.37
NCS2P53923 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.34■□□□□ 0.37
NCS2P53923 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.34■□□□□ 0.37
NCS2P53923 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.34■□□□□ 0.37
NCS2P53923 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.34■□□□□ 0.37
NCS2P53923 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.34■□□□□ 0.37
NCS2P53923 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.34■□□□□ 0.37
NCS2P53923 CCC1YLR220W 969 nt17.17■□□□□ 0.34
NCS2P53923 YBR190WYBR190W 312 nt16.84■□□□□ 0.29
NCS2P53923 ATS1YAL020C 1002 nt16.7■□□□□ 0.26
NCS2P53923 SCJ1YMR214W 1134 nt16.63■□□□□ 0.25
NCS2P53923 PET122YER153C 765 nt16.55■□□□□ 0.24
NCS2P53923 RVS167YDR388W 1449 nt16.51■□□□□ 0.23
NCS2P53923 RTC3YHR087W 336 nt16.47■□□□□ 0.23
NCS2P53923 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.44■□□□□ 0.22
NCS2P53923 SCR1SCR1 522 nt16.4■□□□□ 0.22
NCS2P53923 RRN5YLR141W 1092 nt16.08■□□□□ 0.16
NCS2P53923 SHR5YOL110W 714 nt15.97■□□□□ 0.15
NCS2P53923 YDJ1YNL064C 1230 nt15.91■□□□□ 0.14
NCS2P53923 RSB1YOR049C 1065 nt15.78■□□□□ 0.12
NCS2P53923 SSA3YBL075C 1950 nt15.78■□□□□ 0.12
NCS2P53923 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.77■□□□□ 0.12
NCS2P53923 GAR1YHR089C 618 nt15.53■□□□□ 0.08
NCS2P53923 DEP1YAL013W 1218 nt15.48■□□□□ 0.07
NCS2P53923 URN1YPR152C 1398 nt15.46■□□□□ 0.07
NCS2P53923 PST2YDR032C 597 nt15.44■□□□□ 0.06
NCS2P53923 RPN10YHR200W 807 nt15.26■□□□□ 0.03
NCS2P53923 YNL208WYNL208W 600 nt15.25■□□□□ 0.03
NCS2P53923 OPI9YLR338W 858 nt15.22■□□□□ 0.03
NCS2P53923 PUT4YOR348C 1884 nt15.2■□□□□ 0.02
NCS2P53923 SAH1YER043C 1350 nt15.09■□□□□ 0.01
NCS2P53923 TIR1YER011W 765 nt15.01□□□□□ -0.01
NCS2P53923 ARE1YCR048W 1833 nt14.96□□□□□ -0.01
NCS2P53923 YKL097CYKL097C 411 nt14.89□□□□□ -0.03
NCS2P53923 SSA1YAL005C 1929 nt14.8□□□□□ -0.04
NCS2P53923 SHU1YHL006C 453 nt14.8□□□□□ -0.04
NCS2P53923 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.78□□□□□ -0.04
NCS2P53923 PUN1YLR414C 792 nt14.77□□□□□ -0.05
NCS2P53923 YJR018WYJR018W 363 nt14.75□□□□□ -0.05
NCS2P53923 POA1YBR022W 534 nt14.74□□□□□ -0.05
NCS2P53923 SRB2YHR041C 633 nt14.59□□□□□ -0.07
NCS2P53923 YJR120WYJR120W 351 nt14.57□□□□□ -0.08
NCS2P53923 PTC2YER089C 1395 nt14.57□□□□□ -0.08
NCS2P53923 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.54□□□□□ -0.08
NCS2P53923 RPP2BYDR382W 333 nt14.48□□□□□ -0.09
NCS2P53923 BUD23YCR047C 828 nt14.44□□□□□ -0.1
NCS2P53923 BSC6YOL137W 1494 nt14.4□□□□□ -0.1
NCS2P53923 WWM1YFL010C 636 nt14.37□□□□□ -0.11
NCS2P53923 NAB2YGL122C 1578 nt14.36□□□□□ -0.11
NCS2P53923 YGR021WYGR021W 873 nt14.31□□□□□ -0.12
NCS2P53923 YOR139CYOR139C 393 nt14.28□□□□□ -0.12
NCS2P53923 HOM6YJR139C 1080 nt14.27□□□□□ -0.13
NCS2P53923 MNP1YGL068W 585 nt14.22□□□□□ -0.13
NCS2P53923 BDH2YAL061W 1254 nt14.22□□□□□ -0.13
NCS2P53923 INM2YDR287W 879 nt14.21□□□□□ -0.13
NCS2P53923 DAL1YIR027C 1383 nt14.2□□□□□ -0.14
NCS2P53923 FIS1YIL065C 468 nt14.19□□□□□ -0.14
NCS2P53923 FPR4YLR449W 1179 nt14.17□□□□□ -0.14
NCS2P53923 NPL3YDR432W 1245 nt14.13□□□□□ -0.15
NCS2P53923 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.13□□□□□ -0.15
NCS2P53923 YBL100CYBL100C 315 nt14.1□□□□□ -0.15
NCS2P53923 SPT5YML010W 3192 nt14.08□□□□□ -0.16
NCS2P53923 PHO4YFR034C 939 nt14.07□□□□□ -0.16
NCS2P53923 RKM5YLR137W 1104 nt14.06□□□□□ -0.16
NCS2P53923 LSM3YLR438C-A 270 nt14.06□□□□□ -0.16
NCS2P53923 YOL037CYOL037C 354 nt14.03□□□□□ -0.16
NCS2P53923 SSA4YER103W 1929 nt14□□□□□ -0.17
NCS2P53923 FUN26YAL022C 1554 nt13.93□□□□□ -0.18
NCS2P53923 TRM9YML014W 840 nt13.93□□□□□ -0.18
NCS2P53923 CCT6YDR188W 1641 nt13.78□□□□□ -0.2
NCS2P53923 YPS1YLR120C 1710 nt13.75□□□□□ -0.21
NCS2P53923 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.72□□□□□ -0.21
NCS2P53923 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.72□□□□□ -0.21
NCS2P53923 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.72□□□□□ -0.21
NCS2P53923 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.72□□□□□ -0.21
NCS2P53923 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.72□□□□□ -0.21
NCS2P53923 YLR281CYLR281C 468 nt13.7□□□□□ -0.22
NCS2P53923 ALF1YNL148C 765 nt13.7□□□□□ -0.22
NCS2P53923 YDR095CYDR095C 411 nt13.69□□□□□ -0.22
NCS2P53923 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.65□□□□□ -0.22
NCS2P53923 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.65□□□□□ -0.22
NCS2P53923 WHI5YOR083W 888 nt13.64□□□□□ -0.23
NCS2P53923 PUS2YGL063W 1113 nt13.59□□□□□ -0.23
NCS2P53923 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.6 ms