Protein–RNA interactions for Protein: Q12463

TRM11, tRNA (guanine(10)-N2)-methyltransferase, yeastyeast

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM11Q12463 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.94■■□□□ 1.26
TRM11Q12463 NOP1YDL014W 984 nt22.46■■□□□ 1.19
TRM11Q12463 NSR1YGR159C 1245 nt22.45■■□□□ 1.18
TRM11Q12463 YKL036CYKL036C 393 nt21.09■□□□□ 0.97
TRM11Q12463 Q0297Q0297 156 nt19.78■□□□□ 0.76
TRM11Q12463 YJL027CYJL027C 417 nt19.77■□□□□ 0.76
TRM11Q12463 SRX1YKL086W 384 nt19.62■□□□□ 0.73
TRM11Q12463 MDJ1YFL016C 1536 nt19.56■□□□□ 0.72
TRM11Q12463 SCS3YGL126W 1143 nt19.39■□□□□ 0.69
TRM11Q12463 YCR051WYCR051W 669 nt18.67■□□□□ 0.58
TRM11Q12463 YOL085CYOL085C 342 nt18.26■□□□□ 0.51
TRM11Q12463 PKP1YIL042C 1185 nt17.95■□□□□ 0.46
TRM11Q12463 RPP1BYDL130W 321 nt17.76■□□□□ 0.43
TRM11Q12463 SCJ1YMR214W 1134 nt17.66■□□□□ 0.42
TRM11Q12463 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.5■□□□□ 0.39
TRM11Q12463 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.5■□□□□ 0.39
TRM11Q12463 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.5■□□□□ 0.39
TRM11Q12463 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.5■□□□□ 0.39
TRM11Q12463 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.5■□□□□ 0.39
TRM11Q12463 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.5■□□□□ 0.39
TRM11Q12463 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.5■□□□□ 0.39
TRM11Q12463 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.5■□□□□ 0.39
TRM11Q12463 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.5■□□□□ 0.39
TRM11Q12463 ATS1YAL020C 1002 nt17.46■□□□□ 0.39
TRM11Q12463 DBP2YNL112W 1641 nt17.45■□□□□ 0.38
TRM11Q12463 CCC1YLR220W 969 nt17.36■□□□□ 0.37
TRM11Q12463 PET122YER153C 765 nt16.92■□□□□ 0.3
TRM11Q12463 SCR1SCR1 522 nt16.85■□□□□ 0.29
TRM11Q12463 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.7■□□□□ 0.26
TRM11Q12463 YBR190WYBR190W 312 nt16.57■□□□□ 0.24
TRM11Q12463 RVS167YDR388W 1449 nt16.52■□□□□ 0.23
TRM11Q12463 RRN5YLR141W 1092 nt16.48■□□□□ 0.23
TRM11Q12463 RTC3YHR087W 336 nt16.26■□□□□ 0.19
TRM11Q12463 RSB1YOR049C 1065 nt16.26■□□□□ 0.19
TRM11Q12463 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.15■□□□□ 0.18
TRM11Q12463 YDJ1YNL064C 1230 nt16.14■□□□□ 0.17
TRM11Q12463 PST2YDR032C 597 nt16.1■□□□□ 0.17
TRM11Q12463 SHR5YOL110W 714 nt16.03■□□□□ 0.16
TRM11Q12463 GAR1YHR089C 618 nt15.74■□□□□ 0.11
TRM11Q12463 YKL097CYKL097C 411 nt15.67■□□□□ 0.1
TRM11Q12463 DEP1YAL013W 1218 nt15.47■□□□□ 0.07
TRM11Q12463 SHU1YHL006C 453 nt15.35■□□□□ 0.05
TRM11Q12463 URN1YPR152C 1398 nt15.35■□□□□ 0.05
TRM11Q12463 YNL208WYNL208W 600 nt15.25■□□□□ 0.03
TRM11Q12463 RPN10YHR200W 807 nt15.21■□□□□ 0.03
TRM11Q12463 TIR1YER011W 765 nt15.19■□□□□ 0.02
TRM11Q12463 OPI9YLR338W 858 nt15.04■□□□□ -0
TRM11Q12463 SSA3YBL075C 1950 nt15.02■□□□□ -0
TRM11Q12463 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.01□□□□□ -0.01
TRM11Q12463 YOR139CYOR139C 393 nt14.97□□□□□ -0.01
TRM11Q12463 SSA1YAL005C 1929 nt14.92□□□□□ -0.02
TRM11Q12463 SAH1YER043C 1350 nt14.85□□□□□ -0.03
TRM11Q12463 NPL3YDR432W 1245 nt14.77□□□□□ -0.05
TRM11Q12463 SRB2YHR041C 633 nt14.74□□□□□ -0.05
TRM11Q12463 PUT4YOR348C 1884 nt14.72□□□□□ -0.05
TRM11Q12463 YJR018WYJR018W 363 nt14.67□□□□□ -0.06
TRM11Q12463 YGR021WYGR021W 873 nt14.62□□□□□ -0.07
TRM11Q12463 PUN1YLR414C 792 nt14.61□□□□□ -0.07
TRM11Q12463 WWM1YFL010C 636 nt14.59□□□□□ -0.07
TRM11Q12463 ARE1YCR048W 1833 nt14.59□□□□□ -0.07
TRM11Q12463 MNP1YGL068W 585 nt14.58□□□□□ -0.08
TRM11Q12463 HOM6YJR139C 1080 nt14.58□□□□□ -0.08
TRM11Q12463 YJR120WYJR120W 351 nt14.51□□□□□ -0.09
TRM11Q12463 YOL037CYOL037C 354 nt14.49□□□□□ -0.09
TRM11Q12463 RPP2BYDR382W 333 nt14.48□□□□□ -0.09
TRM11Q12463 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.41□□□□□ -0.1
TRM11Q12463 RKM5YLR137W 1104 nt14.37□□□□□ -0.11
TRM11Q12463 PTC2YER089C 1395 nt14.36□□□□□ -0.11
TRM11Q12463 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.36□□□□□ -0.11
TRM11Q12463 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.36□□□□□ -0.11
TRM11Q12463 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.36□□□□□ -0.11
TRM11Q12463 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.36□□□□□ -0.11
TRM11Q12463 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.36□□□□□ -0.11
TRM11Q12463 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.34□□□□□ -0.11
TRM11Q12463 POA1YBR022W 534 nt14.34□□□□□ -0.11
TRM11Q12463 BDH2YAL061W 1254 nt14.25□□□□□ -0.13
TRM11Q12463 LSM3YLR438C-A 270 nt14.15□□□□□ -0.14
TRM11Q12463 BUD23YCR047C 828 nt14.14□□□□□ -0.15
TRM11Q12463 PUS2YGL063W 1113 nt14.13□□□□□ -0.15
TRM11Q12463 YLR281CYLR281C 468 nt14.13□□□□□ -0.15
TRM11Q12463 NAB2YGL122C 1578 nt14.12□□□□□ -0.15
TRM11Q12463 INM2YDR287W 879 nt14.1□□□□□ -0.15
TRM11Q12463 YBL100CYBL100C 315 nt14.03□□□□□ -0.16
TRM11Q12463 WHI5YOR083W 888 nt14.03□□□□□ -0.16
TRM11Q12463 FPR4YLR449W 1179 nt14.01□□□□□ -0.17
TRM11Q12463 DAL1YIR027C 1383 nt14□□□□□ -0.17
TRM11Q12463 MOT3YMR070W 1473 nt13.96□□□□□ -0.17
TRM11Q12463 FIS1YIL065C 468 nt13.94□□□□□ -0.18
TRM11Q12463 TRM9YML014W 840 nt13.93□□□□□ -0.18
TRM11Q12463 BSC6YOL137W 1494 nt13.93□□□□□ -0.18
TRM11Q12463 PHO4YFR034C 939 nt13.88□□□□□ -0.19
TRM11Q12463 FUN26YAL022C 1554 nt13.88□□□□□ -0.19
TRM11Q12463 FMP45YDL222C 930 nt13.77□□□□□ -0.21
TRM11Q12463 DSK2YMR276W 1122 nt13.77□□□□□ -0.21
TRM11Q12463 YPR011CYPR011C 981 nt13.77□□□□□ -0.21
TRM11Q12463 CCT6YDR188W 1641 nt13.75□□□□□ -0.21
TRM11Q12463 SPT5YML010W 3192 nt13.74□□□□□ -0.21
TRM11Q12463 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.73□□□□□ -0.21
TRM11Q12463 IMP2'YIL154C 1041 nt13.71□□□□□ -0.21
TRM11Q12463 YLR236CYLR236C 324 nt13.71□□□□□ -0.21
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