RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614363.4

C6orf48-210, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene C6orf48, Length 748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-210ENST00000614363 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.59■■■■■ 4.57
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C6orf48-210ENST00000614363 NACADO15069 1562 aa36.14■■■■□ 3.38
C6orf48-210ENST00000614363 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.1■■■■□ 3.37
C6orf48-210ENST00000614363 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.08■■■■□ 3.37
C6orf48-210ENST00000614363 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.07■■■■□ 3.36
C6orf48-210ENST00000614363 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.06■■■■□ 3.36
C6orf48-210ENST00000614363 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.4■■■■□ 3.26
C6orf48-210ENST00000614363 SCRIBQ14160 1630 aa35.23■■■■□ 3.23
C6orf48-210ENST00000614363 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.02■■■■□ 3.2
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C6orf48-210ENST00000614363 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.75■■■■□ 3.15
C6orf48-210ENST00000614363 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.63■■■■□ 3.13
C6orf48-210ENST00000614363 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.02■■■■□ 3.04
C6orf48-210ENST00000614363 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.9■■■■□ 3.02
C6orf48-210ENST00000614363 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.77■■■■□ 3
C6orf48-210ENST00000614363 SMARCA4P51532 1647 aa33.76■■■■□ 3
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C6orf48-210ENST00000614363 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.61■■■□□ 2.97
C6orf48-210ENST00000614363 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.43■■■□□ 2.94
C6orf48-210ENST00000614363 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.41■■■□□ 2.94
C6orf48-210ENST00000614363 SMARCA2P51531 1590 aa33.4■■■□□ 2.94
C6orf48-210ENST00000614363 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.36■■■□□ 2.93
C6orf48-210ENST00000614363 NCAPD3P42695 1498 aa33.31■■■□□ 2.92
C6orf48-210ENST00000614363 WIZO95785 1651 aa33.31■■■□□ 2.92
C6orf48-210ENST00000614363 HMGXB3Q12766 1538 aa33.23■■■□□ 2.91
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C6orf48-210ENST00000614363 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.56■■■□□ 2.8
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C6orf48-210ENST00000614363 NESP48681 1621 aa32.4■■■□□ 2.78
C6orf48-210ENST00000614363 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.4■■■□□ 2.78
C6orf48-210ENST00000614363 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.33■■■□□ 2.77
C6orf48-210ENST00000614363 CFTRP13569 1480 aa32.29■■■□□ 2.76
C6orf48-210ENST00000614363 PRDM2Q13029 1718 aa32.22■■■□□ 2.75
C6orf48-210ENST00000614363 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.11■■■□□ 2.73
C6orf48-210ENST00000614363 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.09■■■□□ 2.73
C6orf48-210ENST00000614363 ERCC6Q03468 1493 aa32.03■■■□□ 2.72
C6orf48-210ENST00000614363 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.99■■■□□ 2.71
C6orf48-210ENST00000614363 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.91■■■□□ 2.7
C6orf48-210ENST00000614363 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.87■■■□□ 2.69
C6orf48-210ENST00000614363 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.78■■■□□ 2.68
C6orf48-210ENST00000614363 WDR62O43379 1518 aa31.7■■■□□ 2.66
C6orf48-210ENST00000614363 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
C6orf48-210ENST00000614363 CUX2O14529 1486 aa31.59■■■□□ 2.65
C6orf48-210ENST00000614363 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.58■■■□□ 2.65
C6orf48-210ENST00000614363 TOPBP1Q92547 1522 aa31.56■■■□□ 2.64
C6orf48-210ENST00000614363 ABCC8Q09428 1581 aa31.54■■■□□ 2.64
C6orf48-210ENST00000614363 CUX1P39880 1505 aa31.51■■■□□ 2.63
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C6orf48-210ENST00000614363 SYNJ1O43426 1573 aa31.39■■■□□ 2.62
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C6orf48-210ENST00000614363 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.31■■■□□ 2.6
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C6orf48-210ENST00000614363 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.16■■■□□ 2.58
C6orf48-210ENST00000614363 SOGA1O94964 1423 aa31.15■■■□□ 2.58
C6orf48-210ENST00000614363 WDR97A6NE52 1622 aa31.13■■■□□ 2.57
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C6orf48-210ENST00000614363 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.03■■■□□ 2.56
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C6orf48-210ENST00000614363 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.92■■■□□ 2.54
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C6orf48-210ENST00000614363 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.89■■■□□ 2.54
C6orf48-210ENST00000614363 PBRM1Q86U86 1689 aa30.84■■■□□ 2.53
C6orf48-210ENST00000614363 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.82■■■□□ 2.52
C6orf48-210ENST00000614363 GRIN2BQ13224 1484 aa30.75■■■□□ 2.51
C6orf48-210ENST00000614363 KIF27Q86VH2 1401 aa30.71■■■□□ 2.51
C6orf48-210ENST00000614363 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.67■■■□□ 2.5
C6orf48-210ENST00000614363 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.66■■■□□ 2.5
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C6orf48-210ENST00000614363 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.63■■■□□ 2.49
C6orf48-210ENST00000614363 ADAMTS12P58397 1594 aa30.58■■■□□ 2.49
C6orf48-210ENST00000614363 CHD1O14646 1710 aa30.57■■■□□ 2.48
C6orf48-210ENST00000614363 IGF1RP08069 1367 aa30.54■■■□□ 2.48
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C6orf48-210ENST00000614363 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.47■■■□□ 2.47
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C6orf48-210ENST00000614363 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
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C6orf48-210ENST00000614363 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.29■■■□□ 2.44
C6orf48-210ENST00000614363 PRXQ9BXM0 1461 aa30.28■■■□□ 2.44
C6orf48-210ENST00000614363 OSCARQ8IYS5 282 aa30.27■■■□□ 2.44
C6orf48-210ENST00000614363 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
C6orf48-210ENST00000614363 CEP170Q5SW79 1584 aa30.25■■■□□ 2.43
C6orf48-210ENST00000614363 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.25■■■□□ 2.43
C6orf48-210ENST00000614363 NUP160Q12769 1436 aa30.22■■■□□ 2.43
C6orf48-210ENST00000614363 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.2■■■□□ 2.42
C6orf48-210ENST00000614363 KIF21BO75037 1637 aa30.16■■■□□ 2.42
C6orf48-210ENST00000614363 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.05■■■□□ 2.4
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