Protein–RNA interactions for Protein: Q15061

WDR43, WD repeat-containing protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR43Q15061 AL355987.4-202ENST00000459985 1900 ntTSL 230.99■■■□□ 2.558e-8■□□□□ 8.2
WDR43Q15061 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.48e-8■□□□□ 8.2
WDR43Q15061 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.461e-6■□□□□ 8.2
WDR43Q15061 DHRS2-203ENST00000432832 834 ntTSL 226.99■■□□□ 1.912e-13■□□□□ 8.2
WDR43Q15061 DHRS2-205ENST00000553896 1352 ntTSL 1 (best)26.95■■□□□ 1.92e-13■□□□□ 8.2
WDR43Q15061 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.288e-17■□□□□ 8.1
WDR43Q15061 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.928e-17■□□□□ 8.1
WDR43Q15061 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.98e-17■□□□□ 8.1
WDR43Q15061 LENG8-203ENST00000421200 594 ntTSL 319.1■□□□□ 0.658e-17■□□□□ 8.1
WDR43Q15061 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.68e-17■□□□□ 8.1
WDR43Q15061 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.568e-17■□□□□ 8.1
WDR43Q15061 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.548e-17■□□□□ 8.1
WDR43Q15061 PRAME-209ENST00000439106 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 318.26■□□□□ 0.518e-17■□□□□ 8.1
WDR43Q15061 PRAME-211ENST00000476336 589 ntTSL 217.66■□□□□ 0.428e-17■□□□□ 8.1
WDR43Q15061 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.368e-17■□□□□ 8.1
WDR43Q15061 PRAME-203ENST00000402697 2057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.358e-17■□□□□ 8.1
WDR43Q15061 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.348e-17■□□□□ 8.1
WDR43Q15061 PRAME-213ENST00000492657 2831 ntTSL 1 (best)17.08■□□□□ 0.328e-17■□□□□ 8.1
WDR43Q15061 PRAME-207ENST00000420709 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.81■□□□□ 0.288e-17■□□□□ 8.1
WDR43Q15061 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.288e-17■□□□□ 8.1
WDR43Q15061 PRAME-212ENST00000485532 709 ntTSL 316.53■□□□□ 0.248e-17■□□□□ 8.1
WDR43Q15061 PRAME-208ENST00000438888 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 416.37■□□□□ 0.218e-17■□□□□ 8.1
WDR43Q15061 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.368e-10■□□□□ 8.1
WDR43Q15061 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.938e-10■□□□□ 8.1
WDR43Q15061 SPPL2B-213ENST00000621568 1017 ntTSL 523.76■■□□□ 1.398e-10■□□□□ 8.1
WDR43Q15061 SPPL2B-214ENST00000622308 749 ntTSL 1 (best)22.29■■□□□ 1.168e-10■□□□□ 8.1
WDR43Q15061 SPPL2B-208ENST00000612623 495 ntTSL 521.81■■□□□ 1.088e-10■□□□□ 8.1
WDR43Q15061 SPPL2B-206ENST00000593243 551 ntTSL 420.7■□□□□ 0.98e-10■□□□□ 8.1
WDR43Q15061 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.838e-10■□□□□ 8.1
WDR43Q15061 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.478e-10■□□□□ 8.1
WDR43Q15061 ATP1A1-208ENST00000488733 1728 ntTSL 226.94■■□□□ 1.91e-7■□□□□ 8.1
WDR43Q15061 ATP1A1-204ENST00000418797 654 ntTSL 326■■□□□ 1.751e-7■□□□□ 8.1
WDR43Q15061 ATP1A1-201ENST00000295598 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.331e-7■□□□□ 8.1
WDR43Q15061 ATP1A1-211ENST00000537345 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.011e-7■□□□□ 8.1
WDR43Q15061 ATP1A1-202ENST00000369494 698 ntTSL 312.02□□□□□ -0.491e-7■□□□□ 8.1
WDR43Q15061 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.021e-7■□□□□ 8.1
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WDR43Q15061 UBAP2L-205ENST00000412596 980 ntTSL 533.64■■■□□ 2.983e-7■□□□□ 8.1
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WDR43Q15061 UBAP2L-207ENST00000428931 3988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.123e-7■□□□□ 8.1
WDR43Q15061 UBAP2L-201ENST00000271877 3997 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.33e-7■□□□□ 8.1
WDR43Q15061 UBAP2L-202ENST00000343815 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.583e-7■□□□□ 8.1
WDR43Q15061 UBAP2L-220ENST00000613315 3451 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.583e-7■□□□□ 8.1
WDR43Q15061 UBAP2L-203ENST00000361546 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.843e-7■□□□□ 8.1
WDR43Q15061 MRPS6-202ENST00000477091 1061 ntTSL 523.3■■□□□ 1.322e-6■□□□□ 8
WDR43Q15061 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.92e-6■□□□□ 8
WDR43Q15061 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.812e-6■□□□□ 8
WDR43Q15061 MRPS6-205ENST00000488492 909 ntTSL 57.56□□□□□ -1.22e-6■□□□□ 8
WDR43Q15061 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.662e-6■□□□□ 8
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