RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412596.5

UBAP2L-205, Transcript of ubiquitin associated protein 2 like, humanhuman

TSL 5

Gene UBAP2L, Length 980 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2L-205ENST00000412596 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.64■■■■■ 7.94
UBAP2L-205ENST00000412596 ABCC9O60706 1549 aa58.06■■■■■ 6.89
UBAP2L-205ENST00000412596 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.05■■■■■ 6.88
UBAP2L-205ENST00000412596 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.27■■■■■ 6.44
UBAP2L-205ENST00000412596 NACADO15069 1562 aa54.88■■■■■ 6.38
UBAP2L-205ENST00000412596 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.55■■■■■ 6.32
UBAP2L-205ENST00000412596 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.44■■■■■ 6.31
UBAP2L-205ENST00000412596 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.11■■■■■ 6.25
UBAP2L-205ENST00000412596 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.04■■■■■ 6.24
UBAP2L-205ENST00000412596 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.99■■■■■ 6.23
UBAP2L-205ENST00000412596 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.64■■■■■ 6.18
UBAP2L-205ENST00000412596 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.59■■■■■ 6.17
UBAP2L-205ENST00000412596 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.41■■■■■ 6.14
UBAP2L-205ENST00000412596 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.96■■■■■ 6.07
UBAP2L-205ENST00000412596 SCRIBQ14160 1630 aa52.89■■■■■ 6.06
UBAP2L-205ENST00000412596 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.45■■■■■ 5.99
UBAP2L-205ENST00000412596 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.34■■■■■ 5.97
UBAP2L-205ENST00000412596 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.32■■■■■ 5.97
UBAP2L-205ENST00000412596 NCAPD3P42695 1498 aa50.65■■■■■ 5.7
UBAP2L-205ENST00000412596 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.5■■■■■ 5.67
UBAP2L-205ENST00000412596 SMARCA4P51532 1647 aa50.45■■■■■ 5.67
UBAP2L-205ENST00000412596 SMARCA2P51531 1590 aa50.38■■■■■ 5.66
UBAP2L-205ENST00000412596 HMGXB3Q12766 1538 aa50.3■■■■■ 5.64
UBAP2L-205ENST00000412596 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.21■■■■■ 5.63
UBAP2L-205ENST00000412596 ERCC6Q03468 1493 aa50.17■■■■■ 5.62
UBAP2L-205ENST00000412596 CUX2O14529 1486 aa50.08■■■■■ 5.61
UBAP2L-205ENST00000412596 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.03■■■■■ 5.6
UBAP2L-205ENST00000412596 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.03■■■■■ 5.6
UBAP2L-205ENST00000412596 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.96■■■■■ 5.59
UBAP2L-205ENST00000412596 NESP48681 1621 aa49.86■■■■■ 5.57
UBAP2L-205ENST00000412596 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.81■■■■■ 5.56
UBAP2L-205ENST00000412596 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.53■■■■■ 5.52
UBAP2L-205ENST00000412596 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.39■■■■■ 5.5
UBAP2L-205ENST00000412596 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.25■■■■■ 5.47
UBAP2L-205ENST00000412596 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.23■■■■■ 5.47
UBAP2L-205ENST00000412596 WIZO95785 1651 aa49.2■■■■■ 5.47
UBAP2L-205ENST00000412596 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.11■■■■■ 5.45
UBAP2L-205ENST00000412596 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.84■■■■■ 5.41
UBAP2L-205ENST00000412596 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.76■■■■■ 5.4
UBAP2L-205ENST00000412596 WDR62O43379 1518 aa48.72■■■■■ 5.39
UBAP2L-205ENST00000412596 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.64■■■■■ 5.38
UBAP2L-205ENST00000412596 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.62■■■■■ 5.37
UBAP2L-205ENST00000412596 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.58■■■■■ 5.37
UBAP2L-205ENST00000412596 CFTRP13569 1480 aa48.55■■■■■ 5.36
UBAP2L-205ENST00000412596 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.17■■■■■ 5.3
UBAP2L-205ENST00000412596 PRDM2Q13029 1718 aa48.07■■■■■ 5.29
UBAP2L-205ENST00000412596 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.04■■■■■ 5.28
UBAP2L-205ENST00000412596 TRIM41Q8WV44 630 aa47.85■■■■■ 5.25
UBAP2L-205ENST00000412596 OSCARQ8IYS5 282 aa47.74■■■■■ 5.23
UBAP2L-205ENST00000412596 IFT140Q96RY7 1462 aa47.66■■■■■ 5.22
UBAP2L-205ENST00000412596 TOPBP1Q92547 1522 aa47.65■■■■■ 5.22
UBAP2L-205ENST00000412596 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.57■■■■■ 5.21
UBAP2L-205ENST00000412596 ABCC8Q09428 1581 aa47.54■■■■■ 5.2
UBAP2L-205ENST00000412596 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.48■■■■■ 5.19
UBAP2L-205ENST00000412596 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.33■■■■■ 5.17
UBAP2L-205ENST00000412596 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.22■■■■■ 5.15
UBAP2L-205ENST00000412596 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.16■■■■■ 5.14
UBAP2L-205ENST00000412596 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.16■■■■■ 5.14
UBAP2L-205ENST00000412596 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.16■■■■■ 5.14
UBAP2L-205ENST00000412596 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.16■■■■■ 5.14
UBAP2L-205ENST00000412596 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.13■■■■■ 5.131e-6■■■■□ 20.3
UBAP2L-205ENST00000412596 ARHGEF11O15085 1522 aa47.02■■■■■ 5.12
UBAP2L-205ENST00000412596 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.97■■■■■ 5.11
UBAP2L-205ENST00000412596 CHD1O14646 1710 aa46.97■■■■■ 5.11
UBAP2L-205ENST00000412596 SOGA1O94964 1423 aa46.93■■■■■ 5.1
UBAP2L-205ENST00000412596 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.86■■■■■ 5.09
UBAP2L-205ENST00000412596 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.84■■■■■ 5.09
UBAP2L-205ENST00000412596 FBLN2P98095 1184 aa46.83■■■■■ 5.09
UBAP2L-205ENST00000412596 CUX1P39880 1505 aa46.81■■■■■ 5.08
UBAP2L-205ENST00000412596 WDR97A6NE52 1622 aa46.76■■■■■ 5.08
UBAP2L-205ENST00000412596 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.68■■■■■ 5.06
UBAP2L-205ENST00000412596 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.63■■■■■ 5.06
UBAP2L-205ENST00000412596 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.57■■■■■ 5.05
UBAP2L-205ENST00000412596 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.56■■■■■ 5.04
UBAP2L-205ENST00000412596 GRIN2BQ13224 1484 aa46.55■■■■■ 5.04
UBAP2L-205ENST00000412596 ARAP1Q96P48 1450 aa46.55■■■■■ 5.04
UBAP2L-205ENST00000412596 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.48■■■■■ 5.03
UBAP2L-205ENST00000412596 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.44■■■■■ 5.03
UBAP2L-205ENST00000412596 SYNJ1O43426 1573 aa46.42■■■■■ 5.02
UBAP2L-205ENST00000412596 SYNJ2O15056 1496 aa46.4■■■■■ 5.02
UBAP2L-205ENST00000412596 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.37■■■■■ 5.01
UBAP2L-205ENST00000412596 PBRM1Q86U86 1689 aa46.36■■■■■ 5.01
UBAP2L-205ENST00000412596 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.33■■■■■ 5.01
UBAP2L-205ENST00000412596 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.27■■■■■ 5
UBAP2L-205ENST00000412596 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.14■■■■■ 4.98
UBAP2L-205ENST00000412596 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.14■■■■■ 4.98
UBAP2L-205ENST00000412596 TOP2BQ02880 1626 aa46.06■■■■■ 4.96
UBAP2L-205ENST00000412596 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.06■■■■■ 4.96
UBAP2L-205ENST00000412596 GRIN2AQ12879 1464 aa45.95■■■■■ 4.95
UBAP2L-205ENST00000412596 ADAMTS12P58397 1594 aa45.94■■■■■ 4.94
UBAP2L-205ENST00000412596 NUP160Q12769 1436 aa45.79■■■■■ 4.92
UBAP2L-205ENST00000412596 CEP170Q5SW79 1584 aa45.79■■■■■ 4.92
UBAP2L-205ENST00000412596 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.78■■■■■ 4.92
UBAP2L-205ENST00000412596 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.75■■■■■ 4.91
UBAP2L-205ENST00000412596 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.7■■■■■ 4.91
UBAP2L-205ENST00000412596 SHROOM2Q13796 1616 aa45.59■■■■■ 4.89
UBAP2L-205ENST00000412596 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.35■■■■■ 4.85
UBAP2L-205ENST00000412596 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.29■■■■■ 4.84
UBAP2L-205ENST00000412596 JPH4Q96JJ6 628 aa45.28■■■■■ 4.84
UBAP2L-205ENST00000412596 KIF27Q86VH2 1401 aa45.16■■■■■ 4.82
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