Protein–RNA interactions for Protein: Q12849

GRSF1, G-rich sequence factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRSF1Q12849 MT-ND6-201ENST00000361681 525 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.281e-323■■■■■ 1762.1
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GRSF1Q12849 AL669831.3-207ENST00000635509 941 ntTSL 59.48□□□□□ -0.893e-7■■■■■ 243.2
GRSF1Q12849 AL669831.3-209ENST00000440200 413 ntTSL 55.1□□□□□ -1.593e-7■■■■■ 243.2
GRSF1Q12849 AL669831.3-203ENST00000419394 491 ntTSL 54.18□□□□□ -1.743e-7■■■■■ 243.2
GRSF1Q12849 AL669831.3-205ENST00000641296 1127 nt17.26■□□□□ 0.353e-13■■■■■ 170.6
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GRSF1Q12849 PCBD2-204ENST00000512783 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 149.9
GRSF1Q12849 PCBD2-203ENST00000510013 361 ntTSL 53.49□□□□□ -1.852e-7■■■■■ 149.9
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GRSF1Q12849 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.067e-13■■■■■ 143
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GRSF1Q12849 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.57e-13■■■■■ 143
GRSF1Q12849 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.017e-13■■■■■ 143
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GRSF1Q12849 DGKI-209ENST00000483619 551 ntTSL 46.66□□□□□ -1.344e-20■■■■■ 128.9
GRSF1Q12849 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.724e-20■■■■■ 128.9
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GRSF1Q12849 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.572e-17■■■■■ 116.4
GRSF1Q12849 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.782e-17■■■■■ 116.4
GRSF1Q12849 KIAA0825-201ENST00000329378 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.788e-8■■■■■ 101.5
GRSF1Q12849 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.98e-8■■■■■ 101.5
GRSF1Q12849 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.113e-19■■■■■ 98.5
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GRSF1Q12849 EXOC2-201ENST00000230449 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.763e-23■■■■■ 77.8
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GRSF1Q12849 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.113e-16■■■■■ 68.1
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GRSF1Q12849 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.164e-7■■■■■ 65.7
GRSF1Q12849 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.14e-7■■■■■ 65.7
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GRSF1Q12849 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.054e-7■■■■■ 65.7
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GRSF1Q12849 GOLGA3-202ENST00000450791 8870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.632e-8■■■■■ 64.8
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GRSF1Q12849 PRKDC-207ENST00000536483 834 ntTSL 213.27□□□□□ -0.297e-12■■■■■ 62.7
GRSF1Q12849 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.437e-12■■■■■ 62.7
GRSF1Q12849 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.457e-12■■■■■ 62.7
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GRSF1Q12849 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.341e-15■■■■■ 62.1
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GRSF1Q12849 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.098e-30■■■■■ 61.1
GRSF1Q12849 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.088e-30■■■■■ 61.1
GRSF1Q12849 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.683e-13■■■■■ 60.2
GRSF1Q12849 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.073e-13■■■■■ 60.2
GRSF1Q12849 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.163e-13■■■■■ 60.2
GRSF1Q12849 BANF1-207ENST00000530204 586 ntTSL 59.58□□□□□ -0.883e-9■■■■■ 57.4
GRSF1Q12849 TNS3-201ENST00000311160 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.591e-16■■■■■ 56.5
GRSF1Q12849 TNS3-208ENST00000457718 3836 ntTSL 510.47□□□□□ -0.731e-16■■■■■ 56.5
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GRSF1Q12849 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.031e-11■■■■■ 56.2
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GRSF1Q12849 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.231e-8■■■■■ 51.4
GRSF1Q12849 BANF1-203ENST00000524628 612 ntTSL 215.74■□□□□ 0.111e-8■■■■■ 51.4
GRSF1Q12849 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.081e-8■■■■■ 51.4
GRSF1Q12849 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.141e-8■■■■■ 51.4
GRSF1Q12849 BANF1-206ENST00000528648 362 ntTSL 39.83□□□□□ -0.841e-8■■■■■ 51.4
GRSF1Q12849 BANF1-204ENST00000524663 251 ntTSL 38.69□□□□□ -1.021e-8■■■■■ 51.4
GRSF1Q12849 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.48e-15■■■■■ 49.6
GRSF1Q12849 SMC4-221ENST00000489573 1553 ntTSL 1 (best)21.61■■□□□ 1.052e-14■■■■■ 48.8
GRSF1Q12849 SMC4-209ENST00000468653 1756 ntTSL 218.74■□□□□ 0.592e-14■■■■■ 48.8
GRSF1Q12849 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 217.81■□□□□ 0.442e-14■■■■■ 48.8
GRSF1Q12849 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.372e-14■■■■■ 48.8
GRSF1Q12849 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.042e-14■■■■■ 48.8
GRSF1Q12849 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.362e-14■■■■■ 48.8
GRSF1Q12849 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.772e-14■■■■■ 48.8
GRSF1Q12849 SMC4-213ENST00000472282 667 ntTSL 39.58□□□□□ -0.882e-14■■■■■ 48.8
GRSF1Q12849 SMC4-214ENST00000472991 582 ntTSL 59.37□□□□□ -0.912e-14■■■■■ 48.8
GRSF1Q12849 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 37.71□□□□□ -1.182e-14■■■■■ 48.8
GRSF1Q12849 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 54.6□□□□□ -1.672e-14■■■■■ 48.8
GRSF1Q12849 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 54.21□□□□□ -1.742e-14■■■■■ 48.8
GRSF1Q12849 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 44.16□□□□□ -1.742e-14■■■■■ 48.8
GRSF1Q12849 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.7□□□□□ -2.142e-14■■■■■ 48.8
GRSF1Q12849 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.862e-6■■■■■ 48.7
GRSF1Q12849 TMEM11-205ENST00000584432 1648 ntTSL 220.34■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 48.7
GRSF1Q12849 TMEM11-202ENST00000577419 1246 ntTSL 218.75■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 48.7
GRSF1Q12849 MTND6P4-201ENST00000506002 522 ntBASIC13.04□□□□□ -0.324e-8■■■■■ 48.3
GRSF1Q12849 GORASP2-211ENST00000497928 711 ntTSL 522.23■■□□□ 1.155e-9■■■■■ 44.8
GRSF1Q12849 GORASP2-204ENST00000454751 624 ntTSL 518.67■□□□□ 0.585e-9■■■■■ 44.8
GRSF1Q12849 GORASP2-205ENST00000455067 530 ntTSL 418.45■□□□□ 0.545e-9■■■■■ 44.8
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