Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.272e-9■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 PTBP1-210ENST00000586944 4661 ntTSL 221.21■□□□□ 0.992e-9■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.62e-9■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.562e-9■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.512e-9■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.382e-9■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.372e-9■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.83e-9■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.153e-9■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.43e-16■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.223e-16■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.963e-16■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.273e-16■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 RTN4-211ENST00000438462 656 ntTSL 513.13□□□□□ -0.313e-16■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 RTN4-206ENST00000394611 4161 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.753e-16■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.053e-16■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.093e-16■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 RTN4-214ENST00000486085 955 ntTSL 36.49□□□□□ -1.373e-16■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.673e-16■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.683e-16■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 ELP1-203ENST00000495759 2840 ntTSL 1 (best)8.52□□□□□ -1.053e-8■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 HNRNPD-209ENST00000513584 1240 ntTSL 229.51■■■□□ 2.318e-8■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.942e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 TMED9-204ENST00000507723 1018 ntTSL 217.67■□□□□ 0.422e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 DCAF11-207ENST00000557810 947 ntTSL 227.01■■□□□ 1.919e-7■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 DCAF11-235ENST00000561016 522 ntTSL 420.39■□□□□ 0.859e-7■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 DCAF11-221ENST00000559382 549 ntTSL 519.43■□□□□ 0.79e-7■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 DCAF11-220ENST00000559354 547 ntTSL 417.52■□□□□ 0.49e-7■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 DCAF11-206ENST00000557809 568 ntTSL 415.99■□□□□ 0.159e-7■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 DCAF11-230ENST00000560459 587 ntTSL 413.5□□□□□ -0.259e-7■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 DCAF11-219ENST00000559288 575 ntTSL 411.32□□□□□ -0.69e-7■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.754e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 MDK-209ENST00000489525 1339 ntTSL 530.34■■■□□ 2.454e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.324e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.234e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.174e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 TMPO-209ENST00000549938 696 ntTSL 426.1■■□□□ 1.774e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.744e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.734e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.74e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.684e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.644e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 FDXR-208ENST00000578473 2482 ntTSL 1 (best)25.22■■□□□ 1.634e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.634e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 FDXR-218ENST00000583881 1561 ntTSL 225.14■■□□□ 1.624e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.64e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 FDXR-206ENST00000577509 1912 ntTSL 224.95■■□□□ 1.584e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.534e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.54e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.434e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.424e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.384e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 FDXR-209ENST00000579482 2157 ntTSL 223.57■■□□□ 1.364e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.234e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 TMPO-205ENST00000546828 564 ntTSL 522.46■■□□□ 1.194e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.194e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.184e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.164e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.134e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.114e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.084e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.024e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 GLDC-217ENST00000639840 600 ntTSL 520.63■□□□□ 0.894e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.864e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 OXA1L-204ENST00000431881 889 ntTSL 319.87■□□□□ 0.774e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 ASGR2-206ENST00000576487 1055 ntTSL 1 (best)19.67■□□□□ 0.744e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 ASGR2-205ENST00000574868 1202 ntTSL 519.49■□□□□ 0.714e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 ARID1A-210ENST00000636072 1128 ntTSL 518.31■□□□□ 0.524e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 OXA1L-205ENST00000442110 691 ntTSL 518.28■□□□□ 0.524e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.474e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 ASGR2-204ENST00000450034 932 ntTSL 217.66■□□□□ 0.424e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.344e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.344e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 MRPL2-206ENST00000485654 428 ntTSL 216.33■□□□□ 0.24e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.174e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.174e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 ARID1A-214ENST00000636794 1068 ntTSL 515.15■□□□□ 0.024e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 TMPO-212ENST00000556029 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.054e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 STAU1-209ENST00000456866 643 ntTSL 514.57□□□□□ -0.084e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 EPB41L2-207ENST00000456097 1138 ntTSL 514.44□□□□□ -0.19e-19■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 WRNIP1-201ENST00000380764 1557 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.114e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 EPB41L2-210ENST00000525198 981 ntTSL 514.25□□□□□ -0.139e-19■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 OXA1L-206ENST00000473744 824 ntTSL 314□□□□□ -0.174e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 EPB41L2-217ENST00000527423 962 ntTSL 412.77□□□□□ -0.379e-19■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 YAP1-207ENST00000529029 1415 ntTSL 212.23□□□□□ -0.454e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 EPAS1-209ENST00000475822 551 ntTSL 412.04□□□□□ -0.484e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 RABGAP1-202ENST00000373647 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.524e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 VIRMA-208ENST00000523263 609 ntTSL 311.59□□□□□ -0.554e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 VIRMA-203ENST00000517624 497 ntTSL 311.3□□□□□ -0.64e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 RNF213-212ENST00000570776 544 ntTSL 210.81□□□□□ -0.684e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 EPB41L2-230ENST00000533912 514 ntTSL 510.7□□□□□ -0.79e-19■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 YAP1-203ENST00000524575 1638 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.864e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -14e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 VIRMA-205ENST00000521080 6472 ntTSL 1 (best)8.45□□□□□ -1.064e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 UBQLN1-206ENST00000533705 6055 ntTSL 1 (best)7.85□□□□□ -1.154e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 VIRMA-207ENST00000522263 3219 ntTSL 1 (best)7.63□□□□□ -1.194e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 TMPO-213ENST00000556678 713 ntTSL 57.21□□□□□ -1.264e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.554e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 RABGAP1-205ENST00000456584 3897 ntTSL 25.27□□□□□ -1.574e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 CCNB1-205ENST00000507798 767 ntTSL 35.24□□□□□ -1.574e-6■□□□□ 9.4
Retrieved 100 of 11,245 protein–RNA pairs in 349.6 ms