Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G3

MRPL42, 39S ribosomal protein L42, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL42Q9Y6G3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MRPL42Q9Y6G3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MRPL42Q9Y6G3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MRPL42Q9Y6G3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MRPL42Q9Y6G3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MRPL42Q9Y6G3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MRPL42Q9Y6G3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MRPL42Q9Y6G3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
MRPL42Q9Y6G3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MRPL42Q9Y6G3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MRPL42Q9Y6G3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MRPL42Q9Y6G3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MRPL42Q9Y6G3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MRPL42Q9Y6G3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MRPL42Q9Y6G3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MRPL42Q9Y6G3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MRPL42Q9Y6G3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MRPL42Q9Y6G3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MRPL42Q9Y6G3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
MRPL42Q9Y6G3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MRPL42Q9Y6G3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MRPL42Q9Y6G3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MRPL42Q9Y6G3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MRPL42Q9Y6G3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MRPL42Q9Y6G3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MRPL42Q9Y6G3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MRPL42Q9Y6G3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MRPL42Q9Y6G3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MRPL42Q9Y6G3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MRPL42Q9Y6G3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MRPL42Q9Y6G3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MRPL42Q9Y6G3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MRPL42Q9Y6G3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
MRPL42Q9Y6G3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MRPL42Q9Y6G3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MRPL42Q9Y6G3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MRPL42Q9Y6G3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MRPL42Q9Y6G3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MRPL42Q9Y6G3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MRPL42Q9Y6G3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MRPL42Q9Y6G3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MRPL42Q9Y6G3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MRPL42Q9Y6G3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MRPL42Q9Y6G3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MRPL42Q9Y6G3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MRPL42Q9Y6G3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MRPL42Q9Y6G3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MRPL42Q9Y6G3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MRPL42Q9Y6G3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MRPL42Q9Y6G3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MRPL42Q9Y6G3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MRPL42Q9Y6G3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MRPL42Q9Y6G3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MRPL42Q9Y6G3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MRPL42Q9Y6G3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
MRPL42Q9Y6G3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MRPL42Q9Y6G3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MRPL42Q9Y6G3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MRPL42Q9Y6G3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MRPL42Q9Y6G3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MRPL42Q9Y6G3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MRPL42Q9Y6G3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MRPL42Q9Y6G3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MRPL42Q9Y6G3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MRPL42Q9Y6G3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MRPL42Q9Y6G3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MRPL42Q9Y6G3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MRPL42Q9Y6G3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MRPL42Q9Y6G3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MRPL42Q9Y6G3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MRPL42Q9Y6G3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MRPL42Q9Y6G3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MRPL42Q9Y6G3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MRPL42Q9Y6G3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MRPL42Q9Y6G3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MRPL42Q9Y6G3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MRPL42Q9Y6G3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MRPL42Q9Y6G3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MRPL42Q9Y6G3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MRPL42Q9Y6G3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MRPL42Q9Y6G3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MRPL42Q9Y6G3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MRPL42Q9Y6G3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MRPL42Q9Y6G3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MRPL42Q9Y6G3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MRPL42Q9Y6G3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MRPL42Q9Y6G3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MRPL42Q9Y6G3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MRPL42Q9Y6G3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MRPL42Q9Y6G3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MRPL42Q9Y6G3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MRPL42Q9Y6G3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MRPL42Q9Y6G3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MRPL42Q9Y6G3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MRPL42Q9Y6G3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MRPL42Q9Y6G3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MRPL42Q9Y6G3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MRPL42Q9Y6G3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MRPL42Q9Y6G3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MRPL42Q9Y6G3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms