Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E5

PCDHB4, Protocadherin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB4Q9Y5E5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDHB4Q9Y5E5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHB4Q9Y5E5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHB4Q9Y5E5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHB4Q9Y5E5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHB4Q9Y5E5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHB4Q9Y5E5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDHB4Q9Y5E5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDHB4Q9Y5E5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDHB4Q9Y5E5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDHB4Q9Y5E5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCDHB4Q9Y5E5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCDHB4Q9Y5E5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDHB4Q9Y5E5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDHB4Q9Y5E5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDHB4Q9Y5E5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDHB4Q9Y5E5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PCDHB4Q9Y5E5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHB4Q9Y5E5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHB4Q9Y5E5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHB4Q9Y5E5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHB4Q9Y5E5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHB4Q9Y5E5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDHB4Q9Y5E5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDHB4Q9Y5E5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDHB4Q9Y5E5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDHB4Q9Y5E5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDHB4Q9Y5E5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDHB4Q9Y5E5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDHB4Q9Y5E5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDHB4Q9Y5E5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDHB4Q9Y5E5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCDHB4Q9Y5E5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDHB4Q9Y5E5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDHB4Q9Y5E5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDHB4Q9Y5E5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PCDHB4Q9Y5E5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHB4Q9Y5E5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHB4Q9Y5E5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHB4Q9Y5E5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHB4Q9Y5E5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHB4Q9Y5E5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHB4Q9Y5E5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDHB4Q9Y5E5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDHB4Q9Y5E5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDHB4Q9Y5E5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDHB4Q9Y5E5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHB4Q9Y5E5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHB4Q9Y5E5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHB4Q9Y5E5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHB4Q9Y5E5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHB4Q9Y5E5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHB4Q9Y5E5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDHB4Q9Y5E5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDHB4Q9Y5E5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDHB4Q9Y5E5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDHB4Q9Y5E5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDHB4Q9Y5E5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDHB4Q9Y5E5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHB4Q9Y5E5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHB4Q9Y5E5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHB4Q9Y5E5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHB4Q9Y5E5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHB4Q9Y5E5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHB4Q9Y5E5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHB4Q9Y5E5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHB4Q9Y5E5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHB4Q9Y5E5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHB4Q9Y5E5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHB4Q9Y5E5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHB4Q9Y5E5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHB4Q9Y5E5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHB4Q9Y5E5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHB4Q9Y5E5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHB4Q9Y5E5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHB4Q9Y5E5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHB4Q9Y5E5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHB4Q9Y5E5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHB4Q9Y5E5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHB4Q9Y5E5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHB4Q9Y5E5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHB4Q9Y5E5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHB4Q9Y5E5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHB4Q9Y5E5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHB4Q9Y5E5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHB4Q9Y5E5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHB4Q9Y5E5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHB4Q9Y5E5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDHB4Q9Y5E5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDHB4Q9Y5E5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDHB4Q9Y5E5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDHB4Q9Y5E5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDHB4Q9Y5E5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHB4Q9Y5E5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHB4Q9Y5E5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms