Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FARP1Q9Y4F1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FARP1Q9Y4F1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FARP1Q9Y4F1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FARP1Q9Y4F1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FARP1Q9Y4F1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FARP1Q9Y4F1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FARP1Q9Y4F1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FARP1Q9Y4F1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FARP1Q9Y4F1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FARP1Q9Y4F1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FARP1Q9Y4F1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FARP1Q9Y4F1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FARP1Q9Y4F1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
FARP1Q9Y4F1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FARP1Q9Y4F1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FARP1Q9Y4F1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FARP1Q9Y4F1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FARP1Q9Y4F1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
FARP1Q9Y4F1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
FARP1Q9Y4F1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FARP1Q9Y4F1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FARP1Q9Y4F1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FARP1Q9Y4F1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FARP1Q9Y4F1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FARP1Q9Y4F1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FARP1Q9Y4F1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FARP1Q9Y4F1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FARP1Q9Y4F1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FARP1Q9Y4F1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FARP1Q9Y4F1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FARP1Q9Y4F1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FARP1Q9Y4F1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FARP1Q9Y4F1 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FARP1Q9Y4F1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FARP1Q9Y4F1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FARP1Q9Y4F1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FARP1Q9Y4F1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FARP1Q9Y4F1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FARP1Q9Y4F1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FARP1Q9Y4F1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FARP1Q9Y4F1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FARP1Q9Y4F1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FARP1Q9Y4F1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FARP1Q9Y4F1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FARP1Q9Y4F1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FARP1Q9Y4F1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FARP1Q9Y4F1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FARP1Q9Y4F1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FARP1Q9Y4F1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FARP1Q9Y4F1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FARP1Q9Y4F1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FARP1Q9Y4F1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FARP1Q9Y4F1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FARP1Q9Y4F1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FARP1Q9Y4F1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FARP1Q9Y4F1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FARP1Q9Y4F1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FARP1Q9Y4F1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FARP1Q9Y4F1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FARP1Q9Y4F1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FARP1Q9Y4F1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FARP1Q9Y4F1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 461.4 ms