Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

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Length 1,504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC60.39■■■■■ 7.26
NISCHQ9Y2I1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC60.39■■■■■ 7.26
NISCHQ9Y2I1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC60.38■■■■■ 7.26
NISCHQ9Y2I1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.38■■■■■ 7.26
NISCHQ9Y2I1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC60.38■■■■■ 7.26
NISCHQ9Y2I1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC60.36■■■■■ 7.25
NISCHQ9Y2I1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC60.36■■■■■ 7.25
NISCHQ9Y2I1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.35■■■■■ 7.25
NISCHQ9Y2I1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.35■■■■■ 7.25
NISCHQ9Y2I1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC60.34■■■■■ 7.25
NISCHQ9Y2I1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC60.31■■■■■ 7.24
NISCHQ9Y2I1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.3■■■■■ 7.24
NISCHQ9Y2I1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC60.3■■■■■ 7.24
NISCHQ9Y2I1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC60.3■■■■■ 7.24
NISCHQ9Y2I1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC60.3■■■■■ 7.24
NISCHQ9Y2I1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC60.3■■■■■ 7.24
NISCHQ9Y2I1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.29■■■■■ 7.24
NISCHQ9Y2I1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.29■■■■■ 7.24
NISCHQ9Y2I1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC60.28■■■■■ 7.24
NISCHQ9Y2I1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.28■■■■■ 7.24
NISCHQ9Y2I1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC60.28■■■■■ 7.24
NISCHQ9Y2I1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC60.27■■■■■ 7.24
NISCHQ9Y2I1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC60.25■■■■■ 7.24
NISCHQ9Y2I1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC60.25■■■■■ 7.24
NISCHQ9Y2I1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.24■■■■■ 7.23
NISCHQ9Y2I1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC60.24■■■■■ 7.23
NISCHQ9Y2I1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.24■■■■■ 7.23
NISCHQ9Y2I1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC60.24■■■■■ 7.23
NISCHQ9Y2I1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC60.24■■■■■ 7.23
NISCHQ9Y2I1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC60.24■■■■■ 7.23
NISCHQ9Y2I1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC60.23■■■■■ 7.23
NISCHQ9Y2I1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC60.23■■■■■ 7.23
NISCHQ9Y2I1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.23■■■■■ 7.23
NISCHQ9Y2I1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC60.22■■■■■ 7.23
NISCHQ9Y2I1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC60.22■■■■■ 7.23
NISCHQ9Y2I1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC60.22■■■■■ 7.23
NISCHQ9Y2I1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.21■■■■■ 7.23
NISCHQ9Y2I1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC60.21■■■■■ 7.23
NISCHQ9Y2I1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC60.2■■■■■ 7.23
NISCHQ9Y2I1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC60.2■■■■■ 7.23
NISCHQ9Y2I1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC60.2■■■■■ 7.23
NISCHQ9Y2I1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.18■■■■■ 7.22
NISCHQ9Y2I1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC60.18■■■■■ 7.22
NISCHQ9Y2I1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC60.18■■■■■ 7.22
NISCHQ9Y2I1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.16■■■■■ 7.22
NISCHQ9Y2I1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC60.16■■■■■ 7.22
NISCHQ9Y2I1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.16■■■■■ 7.22
NISCHQ9Y2I1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC60.16■■■■■ 7.22
NISCHQ9Y2I1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC60.15■■■■■ 7.22
NISCHQ9Y2I1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.14■■■■■ 7.22
NISCHQ9Y2I1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC60.14■■■■■ 7.22
NISCHQ9Y2I1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC60.13■■■■■ 7.22
NISCHQ9Y2I1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.13■■■■■ 7.22
NISCHQ9Y2I1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC60.11■■■■■ 7.21
NISCHQ9Y2I1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC60.1■■■■■ 7.21
NISCHQ9Y2I1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC60.1■■■■■ 7.21
NISCHQ9Y2I1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC60.09■■■■■ 7.21
NISCHQ9Y2I1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC60.07■■■■■ 7.21
NISCHQ9Y2I1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC60.06■■■■■ 7.21
NISCHQ9Y2I1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC60.05■■■■■ 7.2
NISCHQ9Y2I1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.05■■■■■ 7.2
NISCHQ9Y2I1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC60.05■■■■■ 7.2
NISCHQ9Y2I1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.04■■■■■ 7.2
NISCHQ9Y2I1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC60.04■■■■■ 7.2
NISCHQ9Y2I1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.03■■■■■ 7.2
NISCHQ9Y2I1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC60.02■■■■■ 7.2
NISCHQ9Y2I1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC60.02■■■■■ 7.2
NISCHQ9Y2I1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC60.02■■■■■ 7.2
NISCHQ9Y2I1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC60■■■■■ 7.2
NISCHQ9Y2I1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC60■■■■■ 7.2
NISCHQ9Y2I1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.99■■■■■ 7.19
NISCHQ9Y2I1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.99■■■■■ 7.19
NISCHQ9Y2I1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.97■■■■■ 7.19
NISCHQ9Y2I1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.95■■■■■ 7.19
NISCHQ9Y2I1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.94■■■■■ 7.19
NISCHQ9Y2I1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.94■■■■■ 7.19
NISCHQ9Y2I1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC59.94■■■■■ 7.19
NISCHQ9Y2I1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC59.94■■■■■ 7.19
NISCHQ9Y2I1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.93■■■■■ 7.18
NISCHQ9Y2I1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC59.89■■■■■ 7.18
NISCHQ9Y2I1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC59.89■■■■■ 7.18
NISCHQ9Y2I1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC59.88■■■■■ 7.18
NISCHQ9Y2I1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC59.87■■■■■ 7.17
NISCHQ9Y2I1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC59.85■■■■■ 7.17
NISCHQ9Y2I1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC59.85■■■■■ 7.17
NISCHQ9Y2I1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.84■■■■■ 7.17
NISCHQ9Y2I1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC59.83■■■■■ 7.17
NISCHQ9Y2I1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC59.82■■■■■ 7.17
NISCHQ9Y2I1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.82■■■■■ 7.17
NISCHQ9Y2I1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC59.82■■■■■ 7.17
NISCHQ9Y2I1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC59.8■■■■■ 7.16
NISCHQ9Y2I1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.8■■■■■ 7.16
NISCHQ9Y2I1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC59.8■■■■■ 7.16
NISCHQ9Y2I1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.79■■■■■ 7.16
NISCHQ9Y2I1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC59.77■■■■■ 7.16
NISCHQ9Y2I1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC59.76■■■■■ 7.16
NISCHQ9Y2I1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.76■■■■■ 7.16
NISCHQ9Y2I1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.75■■■■■ 7.16
NISCHQ9Y2I1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC59.75■■■■■ 7.15
NISCHQ9Y2I1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC59.74■■■■■ 7.15
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