Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCE1Q9Y256 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCE1Q9Y256 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCE1Q9Y256 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCE1Q9Y256 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCE1Q9Y256 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCE1Q9Y256 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCE1Q9Y256 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RCE1Q9Y256 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCE1Q9Y256 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCE1Q9Y256 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCE1Q9Y256 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCE1Q9Y256 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCE1Q9Y256 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCE1Q9Y256 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCE1Q9Y256 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCE1Q9Y256 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RCE1Q9Y256 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCE1Q9Y256 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCE1Q9Y256 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCE1Q9Y256 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCE1Q9Y256 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCE1Q9Y256 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCE1Q9Y256 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCE1Q9Y256 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCE1Q9Y256 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCE1Q9Y256 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCE1Q9Y256 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCE1Q9Y256 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCE1Q9Y256 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCE1Q9Y256 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCE1Q9Y256 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RCE1Q9Y256 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RCE1Q9Y256 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCE1Q9Y256 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RCE1Q9Y256 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCE1Q9Y256 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCE1Q9Y256 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCE1Q9Y256 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCE1Q9Y256 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCE1Q9Y256 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCE1Q9Y256 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCE1Q9Y256 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCE1Q9Y256 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCE1Q9Y256 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCE1Q9Y256 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCE1Q9Y256 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCE1Q9Y256 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCE1Q9Y256 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCE1Q9Y256 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RCE1Q9Y256 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCE1Q9Y256 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCE1Q9Y256 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCE1Q9Y256 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RCE1Q9Y256 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCE1Q9Y256 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCE1Q9Y256 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCE1Q9Y256 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCE1Q9Y256 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCE1Q9Y256 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCE1Q9Y256 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCE1Q9Y256 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCE1Q9Y256 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCE1Q9Y256 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RCE1Q9Y256 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCE1Q9Y256 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCE1Q9Y256 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCE1Q9Y256 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCE1Q9Y256 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCE1Q9Y256 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCE1Q9Y256 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCE1Q9Y256 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCE1Q9Y256 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RCE1Q9Y256 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RCE1Q9Y256 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RCE1Q9Y256 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RCE1Q9Y256 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCE1Q9Y256 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCE1Q9Y256 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCE1Q9Y256 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCE1Q9Y256 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms