Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQM7

CAMK2A, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2AQ9UQM7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAMK2AQ9UQM7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAMK2AQ9UQM7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAMK2AQ9UQM7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAMK2AQ9UQM7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAMK2AQ9UQM7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAMK2AQ9UQM7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAMK2AQ9UQM7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAMK2AQ9UQM7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAMK2AQ9UQM7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAMK2AQ9UQM7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CAMK2AQ9UQM7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAMK2AQ9UQM7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CAMK2AQ9UQM7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAMK2AQ9UQM7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAMK2AQ9UQM7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAMK2AQ9UQM7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAMK2AQ9UQM7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAMK2AQ9UQM7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAMK2AQ9UQM7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAMK2AQ9UQM7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAMK2AQ9UQM7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAMK2AQ9UQM7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAMK2AQ9UQM7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAMK2AQ9UQM7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAMK2AQ9UQM7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAMK2AQ9UQM7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAMK2AQ9UQM7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAMK2AQ9UQM7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAMK2AQ9UQM7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAMK2AQ9UQM7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAMK2AQ9UQM7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAMK2AQ9UQM7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAMK2AQ9UQM7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAMK2AQ9UQM7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAMK2AQ9UQM7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAMK2AQ9UQM7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAMK2AQ9UQM7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAMK2AQ9UQM7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAMK2AQ9UQM7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAMK2AQ9UQM7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAMK2AQ9UQM7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CAMK2AQ9UQM7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAMK2AQ9UQM7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAMK2AQ9UQM7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAMK2AQ9UQM7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAMK2AQ9UQM7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAMK2AQ9UQM7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAMK2AQ9UQM7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAMK2AQ9UQM7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAMK2AQ9UQM7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAMK2AQ9UQM7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAMK2AQ9UQM7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAMK2AQ9UQM7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAMK2AQ9UQM7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAMK2AQ9UQM7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAMK2AQ9UQM7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAMK2AQ9UQM7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAMK2AQ9UQM7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAMK2AQ9UQM7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAMK2AQ9UQM7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAMK2AQ9UQM7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAMK2AQ9UQM7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAMK2AQ9UQM7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAMK2AQ9UQM7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAMK2AQ9UQM7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAMK2AQ9UQM7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAMK2AQ9UQM7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAMK2AQ9UQM7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAMK2AQ9UQM7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAMK2AQ9UQM7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAMK2AQ9UQM7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAMK2AQ9UQM7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAMK2AQ9UQM7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAMK2AQ9UQM7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAMK2AQ9UQM7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAMK2AQ9UQM7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAMK2AQ9UQM7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAMK2AQ9UQM7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CAMK2AQ9UQM7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAMK2AQ9UQM7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAMK2AQ9UQM7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CAMK2AQ9UQM7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAMK2AQ9UQM7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAMK2AQ9UQM7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAMK2AQ9UQM7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAMK2AQ9UQM7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAMK2AQ9UQM7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAMK2AQ9UQM7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAMK2AQ9UQM7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAMK2AQ9UQM7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAMK2AQ9UQM7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAMK2AQ9UQM7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CAMK2AQ9UQM7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAMK2AQ9UQM7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAMK2AQ9UQM7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAMK2AQ9UQM7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAMK2AQ9UQM7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAMK2AQ9UQM7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAMK2AQ9UQM7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms