Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCDHA12Q9UN75 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCDHA12Q9UN75 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCDHA12Q9UN75 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCDHA12Q9UN75 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PCDHA12Q9UN75 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCDHA12Q9UN75 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCDHA12Q9UN75 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCDHA12Q9UN75 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCDHA12Q9UN75 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCDHA12Q9UN75 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCDHA12Q9UN75 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCDHA12Q9UN75 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PCDHA12Q9UN75 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCDHA12Q9UN75 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCDHA12Q9UN75 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCDHA12Q9UN75 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCDHA12Q9UN75 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCDHA12Q9UN75 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCDHA12Q9UN75 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCDHA12Q9UN75 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCDHA12Q9UN75 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCDHA12Q9UN75 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCDHA12Q9UN75 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCDHA12Q9UN75 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PCDHA12Q9UN75 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PCDHA12Q9UN75 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PCDHA12Q9UN75 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCDHA12Q9UN75 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PCDHA12Q9UN75 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PCDHA12Q9UN75 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCDHA12Q9UN75 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCDHA12Q9UN75 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCDHA12Q9UN75 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCDHA12Q9UN75 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCDHA12Q9UN75 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCDHA12Q9UN75 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PCDHA12Q9UN75 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCDHA12Q9UN75 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCDHA12Q9UN75 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCDHA12Q9UN75 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCDHA12Q9UN75 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCDHA12Q9UN75 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCDHA12Q9UN75 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCDHA12Q9UN75 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCDHA12Q9UN75 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCDHA12Q9UN75 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCDHA12Q9UN75 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCDHA12Q9UN75 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PCDHA12Q9UN75 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCDHA12Q9UN75 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCDHA12Q9UN75 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCDHA12Q9UN75 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCDHA12Q9UN75 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCDHA12Q9UN75 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCDHA12Q9UN75 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PCDHA12Q9UN75 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PCDHA12Q9UN75 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCDHA12Q9UN75 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCDHA12Q9UN75 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCDHA12Q9UN75 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCDHA12Q9UN75 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCDHA12Q9UN75 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCDHA12Q9UN75 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCDHA12Q9UN75 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCDHA12Q9UN75 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCDHA12Q9UN75 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCDHA12Q9UN75 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCDHA12Q9UN75 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCDHA12Q9UN75 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCDHA12Q9UN75 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCDHA12Q9UN75 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCDHA12Q9UN75 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHA12Q9UN75 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHA12Q9UN75 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHA12Q9UN75 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCDHA12Q9UN75 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCDHA12Q9UN75 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCDHA12Q9UN75 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCDHA12Q9UN75 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCDHA12Q9UN75 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PCDHA12Q9UN75 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDHA12Q9UN75 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDHA12Q9UN75 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDHA12Q9UN75 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCDHA12Q9UN75 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCDHA12Q9UN75 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCDHA12Q9UN75 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCDHA12Q9UN75 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCDHA12Q9UN75 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCDHA12Q9UN75 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCDHA12Q9UN75 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCDHA12Q9UN75 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCDHA12Q9UN75 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCDHA12Q9UN75 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCDHA12Q9UN75 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PCDHA12Q9UN75 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCDHA12Q9UN75 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PCDHA12Q9UN75 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCDHA12Q9UN75 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms