Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PALD1Q9ULE6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PALD1Q9ULE6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PALD1Q9ULE6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PALD1Q9ULE6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PALD1Q9ULE6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PALD1Q9ULE6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PALD1Q9ULE6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
PALD1Q9ULE6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PALD1Q9ULE6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PALD1Q9ULE6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PALD1Q9ULE6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PALD1Q9ULE6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PALD1Q9ULE6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
PALD1Q9ULE6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PALD1Q9ULE6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PALD1Q9ULE6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PALD1Q9ULE6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PALD1Q9ULE6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PALD1Q9ULE6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PALD1Q9ULE6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PALD1Q9ULE6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PALD1Q9ULE6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PALD1Q9ULE6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PALD1Q9ULE6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PALD1Q9ULE6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PALD1Q9ULE6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PALD1Q9ULE6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PALD1Q9ULE6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PALD1Q9ULE6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PALD1Q9ULE6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PALD1Q9ULE6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PALD1Q9ULE6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PALD1Q9ULE6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PALD1Q9ULE6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PALD1Q9ULE6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PALD1Q9ULE6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PALD1Q9ULE6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PALD1Q9ULE6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PALD1Q9ULE6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PALD1Q9ULE6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PALD1Q9ULE6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PALD1Q9ULE6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PALD1Q9ULE6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PALD1Q9ULE6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PALD1Q9ULE6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PALD1Q9ULE6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PALD1Q9ULE6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PALD1Q9ULE6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PALD1Q9ULE6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PALD1Q9ULE6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PALD1Q9ULE6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PALD1Q9ULE6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PALD1Q9ULE6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PALD1Q9ULE6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PALD1Q9ULE6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PALD1Q9ULE6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PALD1Q9ULE6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PALD1Q9ULE6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PALD1Q9ULE6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PALD1Q9ULE6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PALD1Q9ULE6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PALD1Q9ULE6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PALD1Q9ULE6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
PALD1Q9ULE6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PALD1Q9ULE6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PALD1Q9ULE6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PALD1Q9ULE6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
PALD1Q9ULE6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PALD1Q9ULE6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PALD1Q9ULE6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PALD1Q9ULE6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PALD1Q9ULE6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PALD1Q9ULE6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PALD1Q9ULE6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PALD1Q9ULE6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PALD1Q9ULE6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PALD1Q9ULE6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
PALD1Q9ULE6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PALD1Q9ULE6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PALD1Q9ULE6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PALD1Q9ULE6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PALD1Q9ULE6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PALD1Q9ULE6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PALD1Q9ULE6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PALD1Q9ULE6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PALD1Q9ULE6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PALD1Q9ULE6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PALD1Q9ULE6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PALD1Q9ULE6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PALD1Q9ULE6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
PALD1Q9ULE6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PALD1Q9ULE6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PALD1Q9ULE6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PALD1Q9ULE6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PALD1Q9ULE6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
PALD1Q9ULE6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PALD1Q9ULE6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PALD1Q9ULE6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PALD1Q9ULE6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms