Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PACSIN3Q9UKS6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PACSIN3Q9UKS6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PACSIN3Q9UKS6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PACSIN3Q9UKS6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PACSIN3Q9UKS6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PACSIN3Q9UKS6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PACSIN3Q9UKS6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PACSIN3Q9UKS6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PACSIN3Q9UKS6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PACSIN3Q9UKS6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PACSIN3Q9UKS6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PACSIN3Q9UKS6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PACSIN3Q9UKS6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PACSIN3Q9UKS6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PACSIN3Q9UKS6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PACSIN3Q9UKS6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PACSIN3Q9UKS6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PACSIN3Q9UKS6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PACSIN3Q9UKS6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PACSIN3Q9UKS6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PACSIN3Q9UKS6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PACSIN3Q9UKS6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PACSIN3Q9UKS6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PACSIN3Q9UKS6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PACSIN3Q9UKS6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PACSIN3Q9UKS6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3Q9UKS6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3Q9UKS6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3Q9UKS6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3Q9UKS6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PACSIN3Q9UKS6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PACSIN3Q9UKS6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PACSIN3Q9UKS6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PACSIN3Q9UKS6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PACSIN3Q9UKS6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PACSIN3Q9UKS6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PACSIN3Q9UKS6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PACSIN3Q9UKS6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PACSIN3Q9UKS6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PACSIN3Q9UKS6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PACSIN3Q9UKS6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PACSIN3Q9UKS6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PACSIN3Q9UKS6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PACSIN3Q9UKS6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PACSIN3Q9UKS6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PACSIN3Q9UKS6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PACSIN3Q9UKS6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PACSIN3Q9UKS6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PACSIN3Q9UKS6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PACSIN3Q9UKS6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PACSIN3Q9UKS6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PACSIN3Q9UKS6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PACSIN3Q9UKS6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PACSIN3Q9UKS6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PACSIN3Q9UKS6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PACSIN3Q9UKS6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PACSIN3Q9UKS6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PACSIN3Q9UKS6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PACSIN3Q9UKS6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PACSIN3Q9UKS6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PACSIN3Q9UKS6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PACSIN3Q9UKS6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PACSIN3Q9UKS6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PACSIN3Q9UKS6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PACSIN3Q9UKS6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PACSIN3Q9UKS6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PACSIN3Q9UKS6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PACSIN3Q9UKS6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PACSIN3Q9UKS6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PACSIN3Q9UKS6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PACSIN3Q9UKS6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PACSIN3Q9UKS6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PACSIN3Q9UKS6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PACSIN3Q9UKS6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PACSIN3Q9UKS6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PACSIN3Q9UKS6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PACSIN3Q9UKS6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PACSIN3Q9UKS6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PACSIN3Q9UKS6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PACSIN3Q9UKS6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PACSIN3Q9UKS6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PACSIN3Q9UKS6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PACSIN3Q9UKS6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PACSIN3Q9UKS6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PACSIN3Q9UKS6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PACSIN3Q9UKS6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PACSIN3Q9UKS6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PACSIN3Q9UKS6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PACSIN3Q9UKS6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PACSIN3Q9UKS6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PACSIN3Q9UKS6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PACSIN3Q9UKS6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PACSIN3Q9UKS6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PACSIN3Q9UKS6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PACSIN3Q9UKS6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PACSIN3Q9UKS6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PACSIN3Q9UKS6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PACSIN3Q9UKS6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PACSIN3Q9UKS6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms