Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
STAG3Q9UJ98 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
STAG3Q9UJ98 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
STAG3Q9UJ98 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
STAG3Q9UJ98 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
STAG3Q9UJ98 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
STAG3Q9UJ98 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
STAG3Q9UJ98 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
STAG3Q9UJ98 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
STAG3Q9UJ98 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
STAG3Q9UJ98 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
STAG3Q9UJ98 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
STAG3Q9UJ98 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
STAG3Q9UJ98 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
STAG3Q9UJ98 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
STAG3Q9UJ98 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
STAG3Q9UJ98 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC37.11■■■■□ 3.53
STAG3Q9UJ98 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
STAG3Q9UJ98 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
STAG3Q9UJ98 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
STAG3Q9UJ98 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
STAG3Q9UJ98 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
STAG3Q9UJ98 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
STAG3Q9UJ98 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
STAG3Q9UJ98 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
STAG3Q9UJ98 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
STAG3Q9UJ98 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
STAG3Q9UJ98 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
STAG3Q9UJ98 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
STAG3Q9UJ98 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
STAG3Q9UJ98 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
STAG3Q9UJ98 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
STAG3Q9UJ98 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
STAG3Q9UJ98 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
STAG3Q9UJ98 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
STAG3Q9UJ98 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC37.04■■■■□ 3.52
STAG3Q9UJ98 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
STAG3Q9UJ98 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
STAG3Q9UJ98 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
STAG3Q9UJ98 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
STAG3Q9UJ98 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
STAG3Q9UJ98 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
STAG3Q9UJ98 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
STAG3Q9UJ98 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
STAG3Q9UJ98 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
STAG3Q9UJ98 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
STAG3Q9UJ98 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
STAG3Q9UJ98 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
STAG3Q9UJ98 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
STAG3Q9UJ98 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
STAG3Q9UJ98 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
STAG3Q9UJ98 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
STAG3Q9UJ98 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
STAG3Q9UJ98 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
STAG3Q9UJ98 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
STAG3Q9UJ98 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
STAG3Q9UJ98 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
STAG3Q9UJ98 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
STAG3Q9UJ98 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
STAG3Q9UJ98 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
STAG3Q9UJ98 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
STAG3Q9UJ98 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
STAG3Q9UJ98 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
STAG3Q9UJ98 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
STAG3Q9UJ98 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
STAG3Q9UJ98 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
STAG3Q9UJ98 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
STAG3Q9UJ98 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
STAG3Q9UJ98 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
STAG3Q9UJ98 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
STAG3Q9UJ98 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
STAG3Q9UJ98 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
STAG3Q9UJ98 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
STAG3Q9UJ98 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
STAG3Q9UJ98 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
STAG3Q9UJ98 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
STAG3Q9UJ98 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
STAG3Q9UJ98 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
STAG3Q9UJ98 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
STAG3Q9UJ98 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
STAG3Q9UJ98 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
STAG3Q9UJ98 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
STAG3Q9UJ98 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
STAG3Q9UJ98 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
STAG3Q9UJ98 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
STAG3Q9UJ98 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
STAG3Q9UJ98 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
STAG3Q9UJ98 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
STAG3Q9UJ98 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
STAG3Q9UJ98 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
STAG3Q9UJ98 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
STAG3Q9UJ98 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
STAG3Q9UJ98 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
STAG3Q9UJ98 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
STAG3Q9UJ98 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
STAG3Q9UJ98 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
STAG3Q9UJ98 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
STAG3Q9UJ98 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
STAG3Q9UJ98 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
STAG3Q9UJ98 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 222.2 ms