Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PLXNA1Q9UIW2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PLXNA1Q9UIW2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PLXNA1Q9UIW2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLXNA1Q9UIW2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLXNA1Q9UIW2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLXNA1Q9UIW2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLXNA1Q9UIW2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLXNA1Q9UIW2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLXNA1Q9UIW2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLXNA1Q9UIW2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PLXNA1Q9UIW2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PLXNA1Q9UIW2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PLXNA1Q9UIW2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PLXNA1Q9UIW2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PLXNA1Q9UIW2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PLXNA1Q9UIW2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PLXNA1Q9UIW2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PLXNA1Q9UIW2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PLXNA1Q9UIW2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PLXNA1Q9UIW2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PLXNA1Q9UIW2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PLXNA1Q9UIW2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PLXNA1Q9UIW2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PLXNA1Q9UIW2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PLXNA1Q9UIW2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PLXNA1Q9UIW2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PLXNA1Q9UIW2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PLXNA1Q9UIW2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PLXNA1Q9UIW2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PLXNA1Q9UIW2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PLXNA1Q9UIW2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PLXNA1Q9UIW2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PLXNA1Q9UIW2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PLXNA1Q9UIW2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLXNA1Q9UIW2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLXNA1Q9UIW2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLXNA1Q9UIW2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PLXNA1Q9UIW2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PLXNA1Q9UIW2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PLXNA1Q9UIW2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PLXNA1Q9UIW2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PLXNA1Q9UIW2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PLXNA1Q9UIW2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLXNA1Q9UIW2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLXNA1Q9UIW2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLXNA1Q9UIW2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PLXNA1Q9UIW2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PLXNA1Q9UIW2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PLXNA1Q9UIW2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PLXNA1Q9UIW2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLXNA1Q9UIW2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLXNA1Q9UIW2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PLXNA1Q9UIW2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PLXNA1Q9UIW2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PLXNA1Q9UIW2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLXNA1Q9UIW2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLXNA1Q9UIW2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLXNA1Q9UIW2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLXNA1Q9UIW2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLXNA1Q9UIW2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLXNA1Q9UIW2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLXNA1Q9UIW2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLXNA1Q9UIW2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLXNA1Q9UIW2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLXNA1Q9UIW2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLXNA1Q9UIW2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLXNA1Q9UIW2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PLXNA1Q9UIW2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PLXNA1Q9UIW2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PLXNA1Q9UIW2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLXNA1Q9UIW2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLXNA1Q9UIW2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLXNA1Q9UIW2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLXNA1Q9UIW2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLXNA1Q9UIW2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLXNA1Q9UIW2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLXNA1Q9UIW2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLXNA1Q9UIW2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLXNA1Q9UIW2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLXNA1Q9UIW2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PLXNA1Q9UIW2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PLXNA1Q9UIW2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLXNA1Q9UIW2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLXNA1Q9UIW2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PLXNA1Q9UIW2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLXNA1Q9UIW2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLXNA1Q9UIW2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLXNA1Q9UIW2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLXNA1Q9UIW2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PLXNA1Q9UIW2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PLXNA1Q9UIW2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PLXNA1Q9UIW2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PLXNA1Q9UIW2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PLXNA1Q9UIW2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLXNA1Q9UIW2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLXNA1Q9UIW2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLXNA1Q9UIW2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PLXNA1Q9UIW2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLXNA1Q9UIW2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms