Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF12

PRODH2, Hydroxyproline dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODH2Q9UF12 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRODH2Q9UF12 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRODH2Q9UF12 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRODH2Q9UF12 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRODH2Q9UF12 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRODH2Q9UF12 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRODH2Q9UF12 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRODH2Q9UF12 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRODH2Q9UF12 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRODH2Q9UF12 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRODH2Q9UF12 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRODH2Q9UF12 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRODH2Q9UF12 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRODH2Q9UF12 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRODH2Q9UF12 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRODH2Q9UF12 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRODH2Q9UF12 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRODH2Q9UF12 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRODH2Q9UF12 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRODH2Q9UF12 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRODH2Q9UF12 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRODH2Q9UF12 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRODH2Q9UF12 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRODH2Q9UF12 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRODH2Q9UF12 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRODH2Q9UF12 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRODH2Q9UF12 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRODH2Q9UF12 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRODH2Q9UF12 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRODH2Q9UF12 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRODH2Q9UF12 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRODH2Q9UF12 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRODH2Q9UF12 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRODH2Q9UF12 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRODH2Q9UF12 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRODH2Q9UF12 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRODH2Q9UF12 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRODH2Q9UF12 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRODH2Q9UF12 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRODH2Q9UF12 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRODH2Q9UF12 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRODH2Q9UF12 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRODH2Q9UF12 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRODH2Q9UF12 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRODH2Q9UF12 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRODH2Q9UF12 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRODH2Q9UF12 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRODH2Q9UF12 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRODH2Q9UF12 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRODH2Q9UF12 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRODH2Q9UF12 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PRODH2Q9UF12 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRODH2Q9UF12 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRODH2Q9UF12 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRODH2Q9UF12 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRODH2Q9UF12 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRODH2Q9UF12 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRODH2Q9UF12 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRODH2Q9UF12 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms