Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA2D2Q9NY47 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA2D2Q9NY47 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA2D2Q9NY47 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA2D2Q9NY47 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA2D2Q9NY47 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNA2D2Q9NY47 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNA2D2Q9NY47 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNA2D2Q9NY47 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNA2D2Q9NY47 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNA2D2Q9NY47 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA2D2Q9NY47 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA2D2Q9NY47 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA2D2Q9NY47 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA2D2Q9NY47 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA2D2Q9NY47 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA2D2Q9NY47 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA2D2Q9NY47 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA2D2Q9NY47 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA2D2Q9NY47 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA2D2Q9NY47 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA2D2Q9NY47 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNA2D2Q9NY47 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNA2D2Q9NY47 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNA2D2Q9NY47 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNA2D2Q9NY47 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA2D2Q9NY47 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA2D2Q9NY47 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA2D2Q9NY47 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA2D2Q9NY47 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA2D2Q9NY47 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA2D2Q9NY47 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA2D2Q9NY47 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA2D2Q9NY47 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA2D2Q9NY47 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA2D2Q9NY47 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA2D2Q9NY47 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA2D2Q9NY47 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA2D2Q9NY47 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNA2D2Q9NY47 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA2D2Q9NY47 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA2D2Q9NY47 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA2D2Q9NY47 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA2D2Q9NY47 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA2D2Q9NY47 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNA2D2Q9NY47 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNA2D2Q9NY47 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNA2D2Q9NY47 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNA2D2Q9NY47 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA2D2Q9NY47 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA2D2Q9NY47 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA2D2Q9NY47 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA2D2Q9NY47 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA2D2Q9NY47 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA2D2Q9NY47 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA2D2Q9NY47 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA2D2Q9NY47 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA2D2Q9NY47 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA2D2Q9NY47 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA2D2Q9NY47 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNA2D2Q9NY47 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNA2D2Q9NY47 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CACNA2D2Q9NY47 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNA2D2Q9NY47 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNA2D2Q9NY47 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNA2D2Q9NY47 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNA2D2Q9NY47 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA2D2Q9NY47 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA2D2Q9NY47 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA2D2Q9NY47 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA2D2Q9NY47 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA2D2Q9NY47 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA2D2Q9NY47 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA2D2Q9NY47 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA2D2Q9NY47 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA2D2Q9NY47 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA2D2Q9NY47 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA2D2Q9NY47 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA2D2Q9NY47 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA2D2Q9NY47 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA2D2Q9NY47 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA2D2Q9NY47 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA2D2Q9NY47 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA2D2Q9NY47 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA2D2Q9NY47 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA2D2Q9NY47 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA2D2Q9NY47 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA2D2Q9NY47 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA2D2Q9NY47 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA2D2Q9NY47 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNA2D2Q9NY47 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNA2D2Q9NY47 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNA2D2Q9NY47 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNA2D2Q9NY47 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CACNA2D2Q9NY47 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CACNA2D2Q9NY47 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA2D2Q9NY47 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA2D2Q9NY47 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA2D2Q9NY47 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA2D2Q9NY47 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms