Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDE1Q9NXR1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDE1Q9NXR1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDE1Q9NXR1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDE1Q9NXR1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDE1Q9NXR1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDE1Q9NXR1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDE1Q9NXR1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDE1Q9NXR1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDE1Q9NXR1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDE1Q9NXR1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDE1Q9NXR1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDE1Q9NXR1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDE1Q9NXR1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDE1Q9NXR1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NDE1Q9NXR1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDE1Q9NXR1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NDE1Q9NXR1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NDE1Q9NXR1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NDE1Q9NXR1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NDE1Q9NXR1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDE1Q9NXR1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDE1Q9NXR1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDE1Q9NXR1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDE1Q9NXR1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDE1Q9NXR1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDE1Q9NXR1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDE1Q9NXR1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDE1Q9NXR1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDE1Q9NXR1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NDE1Q9NXR1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDE1Q9NXR1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDE1Q9NXR1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDE1Q9NXR1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDE1Q9NXR1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDE1Q9NXR1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDE1Q9NXR1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDE1Q9NXR1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NDE1Q9NXR1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDE1Q9NXR1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDE1Q9NXR1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDE1Q9NXR1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDE1Q9NXR1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDE1Q9NXR1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDE1Q9NXR1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDE1Q9NXR1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NDE1Q9NXR1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDE1Q9NXR1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDE1Q9NXR1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDE1Q9NXR1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDE1Q9NXR1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDE1Q9NXR1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDE1Q9NXR1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDE1Q9NXR1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NDE1Q9NXR1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDE1Q9NXR1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDE1Q9NXR1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDE1Q9NXR1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDE1Q9NXR1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDE1Q9NXR1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDE1Q9NXR1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDE1Q9NXR1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDE1Q9NXR1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDE1Q9NXR1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDE1Q9NXR1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDE1Q9NXR1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDE1Q9NXR1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NDE1Q9NXR1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NDE1Q9NXR1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NDE1Q9NXR1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDE1Q9NXR1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDE1Q9NXR1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDE1Q9NXR1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDE1Q9NXR1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDE1Q9NXR1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDE1Q9NXR1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDE1Q9NXR1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDE1Q9NXR1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDE1Q9NXR1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDE1Q9NXR1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NDE1Q9NXR1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDE1Q9NXR1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDE1Q9NXR1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDE1Q9NXR1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDE1Q9NXR1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDE1Q9NXR1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDE1Q9NXR1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDE1Q9NXR1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDE1Q9NXR1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDE1Q9NXR1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDE1Q9NXR1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDE1Q9NXR1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDE1Q9NXR1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDE1Q9NXR1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDE1Q9NXR1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDE1Q9NXR1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDE1Q9NXR1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDE1Q9NXR1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDE1Q9NXR1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDE1Q9NXR1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms