Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP1

DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX18Q9NVP1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX18Q9NVP1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX18Q9NVP1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX18Q9NVP1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DDX18Q9NVP1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX18Q9NVP1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX18Q9NVP1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX18Q9NVP1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX18Q9NVP1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX18Q9NVP1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX18Q9NVP1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX18Q9NVP1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX18Q9NVP1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX18Q9NVP1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX18Q9NVP1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX18Q9NVP1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX18Q9NVP1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX18Q9NVP1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX18Q9NVP1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX18Q9NVP1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX18Q9NVP1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX18Q9NVP1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX18Q9NVP1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX18Q9NVP1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX18Q9NVP1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX18Q9NVP1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX18Q9NVP1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX18Q9NVP1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDX18Q9NVP1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX18Q9NVP1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX18Q9NVP1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX18Q9NVP1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX18Q9NVP1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX18Q9NVP1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX18Q9NVP1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX18Q9NVP1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX18Q9NVP1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX18Q9NVP1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX18Q9NVP1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX18Q9NVP1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX18Q9NVP1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX18Q9NVP1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX18Q9NVP1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX18Q9NVP1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX18Q9NVP1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX18Q9NVP1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX18Q9NVP1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX18Q9NVP1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX18Q9NVP1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX18Q9NVP1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX18Q9NVP1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX18Q9NVP1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX18Q9NVP1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX18Q9NVP1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX18Q9NVP1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX18Q9NVP1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDX18Q9NVP1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX18Q9NVP1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX18Q9NVP1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX18Q9NVP1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX18Q9NVP1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX18Q9NVP1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX18Q9NVP1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX18Q9NVP1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX18Q9NVP1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX18Q9NVP1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX18Q9NVP1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX18Q9NVP1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX18Q9NVP1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX18Q9NVP1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX18Q9NVP1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX18Q9NVP1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX18Q9NVP1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX18Q9NVP1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX18Q9NVP1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX18Q9NVP1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX18Q9NVP1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX18Q9NVP1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX18Q9NVP1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX18Q9NVP1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX18Q9NVP1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX18Q9NVP1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX18Q9NVP1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX18Q9NVP1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX18Q9NVP1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX18Q9NVP1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX18Q9NVP1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX18Q9NVP1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX18Q9NVP1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX18Q9NVP1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX18Q9NVP1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX18Q9NVP1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX18Q9NVP1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX18Q9NVP1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX18Q9NVP1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX18Q9NVP1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX18Q9NVP1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX18Q9NVP1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX18Q9NVP1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX18Q9NVP1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms