Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARVAQ9NVD7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARVAQ9NVD7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARVAQ9NVD7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARVAQ9NVD7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARVAQ9NVD7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PARVAQ9NVD7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PARVAQ9NVD7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PARVAQ9NVD7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PARVAQ9NVD7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PARVAQ9NVD7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PARVAQ9NVD7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PARVAQ9NVD7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PARVAQ9NVD7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PARVAQ9NVD7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARVAQ9NVD7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARVAQ9NVD7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARVAQ9NVD7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARVAQ9NVD7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARVAQ9NVD7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARVAQ9NVD7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARVAQ9NVD7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARVAQ9NVD7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARVAQ9NVD7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARVAQ9NVD7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PARVAQ9NVD7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PARVAQ9NVD7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PARVAQ9NVD7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PARVAQ9NVD7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARVAQ9NVD7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARVAQ9NVD7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARVAQ9NVD7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARVAQ9NVD7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARVAQ9NVD7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARVAQ9NVD7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PARVAQ9NVD7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARVAQ9NVD7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARVAQ9NVD7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARVAQ9NVD7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PARVAQ9NVD7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PARVAQ9NVD7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PARVAQ9NVD7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARVAQ9NVD7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARVAQ9NVD7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARVAQ9NVD7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARVAQ9NVD7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PARVAQ9NVD7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PARVAQ9NVD7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARVAQ9NVD7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARVAQ9NVD7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARVAQ9NVD7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARVAQ9NVD7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PARVAQ9NVD7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PARVAQ9NVD7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PARVAQ9NVD7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PARVAQ9NVD7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PARVAQ9NVD7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PARVAQ9NVD7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PARVAQ9NVD7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PARVAQ9NVD7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PARVAQ9NVD7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARVAQ9NVD7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARVAQ9NVD7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARVAQ9NVD7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARVAQ9NVD7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARVAQ9NVD7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARVAQ9NVD7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARVAQ9NVD7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PARVAQ9NVD7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PARVAQ9NVD7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PARVAQ9NVD7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PARVAQ9NVD7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PARVAQ9NVD7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PARVAQ9NVD7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PARVAQ9NVD7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARVAQ9NVD7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARVAQ9NVD7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARVAQ9NVD7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARVAQ9NVD7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PARVAQ9NVD7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PARVAQ9NVD7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PARVAQ9NVD7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PARVAQ9NVD7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PARVAQ9NVD7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PARVAQ9NVD7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PARVAQ9NVD7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PARVAQ9NVD7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARVAQ9NVD7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARVAQ9NVD7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARVAQ9NVD7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARVAQ9NVD7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARVAQ9NVD7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARVAQ9NVD7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARVAQ9NVD7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARVAQ9NVD7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARVAQ9NVD7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARVAQ9NVD7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARVAQ9NVD7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARVAQ9NVD7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARVAQ9NVD7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms