Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX2

MRPL17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL17Q9NRX2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MRPL17Q9NRX2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MRPL17Q9NRX2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MRPL17Q9NRX2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MRPL17Q9NRX2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MRPL17Q9NRX2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MRPL17Q9NRX2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MRPL17Q9NRX2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MRPL17Q9NRX2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MRPL17Q9NRX2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MRPL17Q9NRX2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MRPL17Q9NRX2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MRPL17Q9NRX2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MRPL17Q9NRX2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MRPL17Q9NRX2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MRPL17Q9NRX2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MRPL17Q9NRX2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MRPL17Q9NRX2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MRPL17Q9NRX2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MRPL17Q9NRX2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MRPL17Q9NRX2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MRPL17Q9NRX2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MRPL17Q9NRX2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MRPL17Q9NRX2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MRPL17Q9NRX2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MRPL17Q9NRX2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MRPL17Q9NRX2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MRPL17Q9NRX2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MRPL17Q9NRX2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MRPL17Q9NRX2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MRPL17Q9NRX2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MRPL17Q9NRX2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MRPL17Q9NRX2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MRPL17Q9NRX2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MRPL17Q9NRX2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MRPL17Q9NRX2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MRPL17Q9NRX2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MRPL17Q9NRX2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MRPL17Q9NRX2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MRPL17Q9NRX2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MRPL17Q9NRX2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MRPL17Q9NRX2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MRPL17Q9NRX2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MRPL17Q9NRX2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MRPL17Q9NRX2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MRPL17Q9NRX2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MRPL17Q9NRX2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MRPL17Q9NRX2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MRPL17Q9NRX2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MRPL17Q9NRX2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MRPL17Q9NRX2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MRPL17Q9NRX2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MRPL17Q9NRX2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MRPL17Q9NRX2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MRPL17Q9NRX2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MRPL17Q9NRX2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MRPL17Q9NRX2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MRPL17Q9NRX2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MRPL17Q9NRX2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MRPL17Q9NRX2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MRPL17Q9NRX2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MRPL17Q9NRX2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MRPL17Q9NRX2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MRPL17Q9NRX2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MRPL17Q9NRX2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MRPL17Q9NRX2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MRPL17Q9NRX2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MRPL17Q9NRX2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MRPL17Q9NRX2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MRPL17Q9NRX2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MRPL17Q9NRX2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MRPL17Q9NRX2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MRPL17Q9NRX2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MRPL17Q9NRX2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MRPL17Q9NRX2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MRPL17Q9NRX2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MRPL17Q9NRX2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MRPL17Q9NRX2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MRPL17Q9NRX2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRPL17Q9NRX2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRPL17Q9NRX2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRPL17Q9NRX2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRPL17Q9NRX2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRPL17Q9NRX2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRPL17Q9NRX2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MRPL17Q9NRX2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MRPL17Q9NRX2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MRPL17Q9NRX2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MRPL17Q9NRX2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MRPL17Q9NRX2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MRPL17Q9NRX2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MRPL17Q9NRX2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MRPL17Q9NRX2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MRPL17Q9NRX2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MRPL17Q9NRX2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MRPL17Q9NRX2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MRPL17Q9NRX2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MRPL17Q9NRX2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MRPL17Q9NRX2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MRPL17Q9NRX2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms