Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCDHB16Q9NRJ7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCDHB16Q9NRJ7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCDHB16Q9NRJ7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCDHB16Q9NRJ7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCDHB16Q9NRJ7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCDHB16Q9NRJ7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCDHB16Q9NRJ7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCDHB16Q9NRJ7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCDHB16Q9NRJ7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCDHB16Q9NRJ7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCDHB16Q9NRJ7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCDHB16Q9NRJ7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCDHB16Q9NRJ7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCDHB16Q9NRJ7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCDHB16Q9NRJ7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCDHB16Q9NRJ7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCDHB16Q9NRJ7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCDHB16Q9NRJ7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCDHB16Q9NRJ7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCDHB16Q9NRJ7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCDHB16Q9NRJ7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCDHB16Q9NRJ7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCDHB16Q9NRJ7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCDHB16Q9NRJ7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCDHB16Q9NRJ7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCDHB16Q9NRJ7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCDHB16Q9NRJ7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCDHB16Q9NRJ7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDHB16Q9NRJ7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDHB16Q9NRJ7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDHB16Q9NRJ7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDHB16Q9NRJ7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDHB16Q9NRJ7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDHB16Q9NRJ7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDHB16Q9NRJ7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDHB16Q9NRJ7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDHB16Q9NRJ7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDHB16Q9NRJ7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDHB16Q9NRJ7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDHB16Q9NRJ7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDHB16Q9NRJ7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDHB16Q9NRJ7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDHB16Q9NRJ7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDHB16Q9NRJ7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDHB16Q9NRJ7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDHB16Q9NRJ7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDHB16Q9NRJ7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDHB16Q9NRJ7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDHB16Q9NRJ7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCDHB16Q9NRJ7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDHB16Q9NRJ7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDHB16Q9NRJ7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCDHB16Q9NRJ7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCDHB16Q9NRJ7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCDHB16Q9NRJ7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms