Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR64

KLHL1, Kelch-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL1Q9NR64 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL1Q9NR64 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL1Q9NR64 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL1Q9NR64 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL1Q9NR64 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL1Q9NR64 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL1Q9NR64 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL1Q9NR64 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL1Q9NR64 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL1Q9NR64 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL1Q9NR64 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL1Q9NR64 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL1Q9NR64 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL1Q9NR64 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL1Q9NR64 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL1Q9NR64 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL1Q9NR64 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL1Q9NR64 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL1Q9NR64 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL1Q9NR64 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL1Q9NR64 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL1Q9NR64 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL1Q9NR64 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL1Q9NR64 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL1Q9NR64 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL1Q9NR64 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL1Q9NR64 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL1Q9NR64 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL1Q9NR64 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL1Q9NR64 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL1Q9NR64 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL1Q9NR64 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL1Q9NR64 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL1Q9NR64 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL1Q9NR64 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL1Q9NR64 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL1Q9NR64 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL1Q9NR64 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL1Q9NR64 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL1Q9NR64 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL1Q9NR64 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL1Q9NR64 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL1Q9NR64 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL1Q9NR64 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL1Q9NR64 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL1Q9NR64 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL1Q9NR64 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL1Q9NR64 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL1Q9NR64 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL1Q9NR64 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL1Q9NR64 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL1Q9NR64 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL1Q9NR64 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL1Q9NR64 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL1Q9NR64 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL1Q9NR64 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL1Q9NR64 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL1Q9NR64 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms