Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
APOBEC3GQ9HC16 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
APOBEC3GQ9HC16 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
APOBEC3GQ9HC16 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
APOBEC3GQ9HC16 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
APOBEC3GQ9HC16 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
APOBEC3GQ9HC16 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
APOBEC3GQ9HC16 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
APOBEC3GQ9HC16 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
APOBEC3GQ9HC16 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
APOBEC3GQ9HC16 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
APOBEC3GQ9HC16 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
APOBEC3GQ9HC16 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
APOBEC3GQ9HC16 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
APOBEC3GQ9HC16 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
APOBEC3GQ9HC16 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
APOBEC3GQ9HC16 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
APOBEC3GQ9HC16 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
APOBEC3GQ9HC16 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
APOBEC3GQ9HC16 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
APOBEC3GQ9HC16 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
APOBEC3GQ9HC16 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
APOBEC3GQ9HC16 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
APOBEC3GQ9HC16 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
APOBEC3GQ9HC16 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
APOBEC3GQ9HC16 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
APOBEC3GQ9HC16 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
APOBEC3GQ9HC16 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
APOBEC3GQ9HC16 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
APOBEC3GQ9HC16 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
APOBEC3GQ9HC16 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
APOBEC3GQ9HC16 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
APOBEC3GQ9HC16 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
APOBEC3GQ9HC16 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
APOBEC3GQ9HC16 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
APOBEC3GQ9HC16 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
APOBEC3GQ9HC16 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
APOBEC3GQ9HC16 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
APOBEC3GQ9HC16 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
APOBEC3GQ9HC16 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
APOBEC3GQ9HC16 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOBEC3GQ9HC16 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOBEC3GQ9HC16 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOBEC3GQ9HC16 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOBEC3GQ9HC16 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOBEC3GQ9HC16 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOBEC3GQ9HC16 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOBEC3GQ9HC16 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
APOBEC3GQ9HC16 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
APOBEC3GQ9HC16 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
APOBEC3GQ9HC16 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
APOBEC3GQ9HC16 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOBEC3GQ9HC16 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOBEC3GQ9HC16 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOBEC3GQ9HC16 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOBEC3GQ9HC16 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
APOBEC3GQ9HC16 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APOBEC3GQ9HC16 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
APOBEC3GQ9HC16 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APOBEC3GQ9HC16 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
APOBEC3GQ9HC16 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
APOBEC3GQ9HC16 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
APOBEC3GQ9HC16 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
APOBEC3GQ9HC16 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
APOBEC3GQ9HC16 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APOBEC3GQ9HC16 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APOBEC3GQ9HC16 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APOBEC3GQ9HC16 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
APOBEC3GQ9HC16 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
APOBEC3GQ9HC16 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
APOBEC3GQ9HC16 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
APOBEC3GQ9HC16 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
APOBEC3GQ9HC16 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
APOBEC3GQ9HC16 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
APOBEC3GQ9HC16 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
APOBEC3GQ9HC16 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APOBEC3GQ9HC16 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APOBEC3GQ9HC16 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APOBEC3GQ9HC16 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
APOBEC3GQ9HC16 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APOBEC3GQ9HC16 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
APOBEC3GQ9HC16 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
APOBEC3GQ9HC16 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
APOBEC3GQ9HC16 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
APOBEC3GQ9HC16 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
APOBEC3GQ9HC16 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
APOBEC3GQ9HC16 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
APOBEC3GQ9HC16 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
APOBEC3GQ9HC16 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APOBEC3GQ9HC16 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APOBEC3GQ9HC16 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APOBEC3GQ9HC16 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APOBEC3GQ9HC16 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
APOBEC3GQ9HC16 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOBEC3GQ9HC16 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOBEC3GQ9HC16 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOBEC3GQ9HC16 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
APOBEC3GQ9HC16 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOBEC3GQ9HC16 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms