Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMURF2Q9HAU4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMURF2Q9HAU4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMURF2Q9HAU4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMURF2Q9HAU4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMURF2Q9HAU4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMURF2Q9HAU4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMURF2Q9HAU4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMURF2Q9HAU4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMURF2Q9HAU4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMURF2Q9HAU4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMURF2Q9HAU4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMURF2Q9HAU4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMURF2Q9HAU4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMURF2Q9HAU4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMURF2Q9HAU4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMURF2Q9HAU4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMURF2Q9HAU4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMURF2Q9HAU4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SMURF2Q9HAU4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMURF2Q9HAU4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMURF2Q9HAU4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMURF2Q9HAU4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMURF2Q9HAU4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMURF2Q9HAU4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMURF2Q9HAU4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMURF2Q9HAU4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMURF2Q9HAU4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMURF2Q9HAU4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMURF2Q9HAU4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMURF2Q9HAU4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMURF2Q9HAU4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMURF2Q9HAU4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMURF2Q9HAU4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMURF2Q9HAU4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMURF2Q9HAU4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMURF2Q9HAU4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMURF2Q9HAU4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMURF2Q9HAU4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMURF2Q9HAU4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMURF2Q9HAU4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMURF2Q9HAU4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMURF2Q9HAU4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMURF2Q9HAU4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMURF2Q9HAU4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMURF2Q9HAU4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMURF2Q9HAU4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMURF2Q9HAU4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMURF2Q9HAU4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMURF2Q9HAU4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMURF2Q9HAU4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMURF2Q9HAU4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMURF2Q9HAU4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMURF2Q9HAU4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMURF2Q9HAU4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMURF2Q9HAU4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMURF2Q9HAU4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMURF2Q9HAU4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMURF2Q9HAU4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMURF2Q9HAU4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMURF2Q9HAU4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMURF2Q9HAU4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMURF2Q9HAU4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMURF2Q9HAU4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMURF2Q9HAU4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMURF2Q9HAU4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMURF2Q9HAU4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMURF2Q9HAU4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMURF2Q9HAU4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMURF2Q9HAU4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMURF2Q9HAU4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMURF2Q9HAU4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMURF2Q9HAU4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMURF2Q9HAU4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMURF2Q9HAU4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMURF2Q9HAU4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMURF2Q9HAU4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMURF2Q9HAU4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMURF2Q9HAU4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMURF2Q9HAU4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMURF2Q9HAU4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMURF2Q9HAU4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMURF2Q9HAU4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMURF2Q9HAU4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMURF2Q9HAU4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMURF2Q9HAU4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMURF2Q9HAU4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMURF2Q9HAU4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMURF2Q9HAU4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMURF2Q9HAU4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMURF2Q9HAU4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMURF2Q9HAU4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMURF2Q9HAU4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMURF2Q9HAU4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMURF2Q9HAU4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMURF2Q9HAU4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMURF2Q9HAU4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMURF2Q9HAU4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SMURF2Q9HAU4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMURF2Q9HAU4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms