Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAC7

SUGCT, Succinate--hydroxymethylglutarate CoA-transferase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUGCTQ9HAC7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SUGCTQ9HAC7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SUGCTQ9HAC7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SUGCTQ9HAC7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SUGCTQ9HAC7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SUGCTQ9HAC7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SUGCTQ9HAC7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SUGCTQ9HAC7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SUGCTQ9HAC7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SUGCTQ9HAC7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SUGCTQ9HAC7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SUGCTQ9HAC7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SUGCTQ9HAC7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SUGCTQ9HAC7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SUGCTQ9HAC7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SUGCTQ9HAC7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SUGCTQ9HAC7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SUGCTQ9HAC7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SUGCTQ9HAC7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SUGCTQ9HAC7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SUGCTQ9HAC7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SUGCTQ9HAC7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SUGCTQ9HAC7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SUGCTQ9HAC7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SUGCTQ9HAC7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SUGCTQ9HAC7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SUGCTQ9HAC7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SUGCTQ9HAC7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SUGCTQ9HAC7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SUGCTQ9HAC7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SUGCTQ9HAC7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SUGCTQ9HAC7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SUGCTQ9HAC7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SUGCTQ9HAC7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SUGCTQ9HAC7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SUGCTQ9HAC7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SUGCTQ9HAC7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SUGCTQ9HAC7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SUGCTQ9HAC7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SUGCTQ9HAC7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SUGCTQ9HAC7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SUGCTQ9HAC7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SUGCTQ9HAC7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SUGCTQ9HAC7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SUGCTQ9HAC7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SUGCTQ9HAC7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SUGCTQ9HAC7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SUGCTQ9HAC7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SUGCTQ9HAC7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SUGCTQ9HAC7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SUGCTQ9HAC7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SUGCTQ9HAC7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SUGCTQ9HAC7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SUGCTQ9HAC7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SUGCTQ9HAC7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SUGCTQ9HAC7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SUGCTQ9HAC7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SUGCTQ9HAC7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SUGCTQ9HAC7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SUGCTQ9HAC7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SUGCTQ9HAC7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SUGCTQ9HAC7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SUGCTQ9HAC7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SUGCTQ9HAC7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SUGCTQ9HAC7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SUGCTQ9HAC7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SUGCTQ9HAC7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SUGCTQ9HAC7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SUGCTQ9HAC7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SUGCTQ9HAC7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SUGCTQ9HAC7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SUGCTQ9HAC7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SUGCTQ9HAC7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SUGCTQ9HAC7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SUGCTQ9HAC7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SUGCTQ9HAC7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SUGCTQ9HAC7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SUGCTQ9HAC7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SUGCTQ9HAC7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SUGCTQ9HAC7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SUGCTQ9HAC7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SUGCTQ9HAC7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SUGCTQ9HAC7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SUGCTQ9HAC7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SUGCTQ9HAC7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SUGCTQ9HAC7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SUGCTQ9HAC7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
SUGCTQ9HAC7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SUGCTQ9HAC7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SUGCTQ9HAC7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SUGCTQ9HAC7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SUGCTQ9HAC7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SUGCTQ9HAC7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SUGCTQ9HAC7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SUGCTQ9HAC7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SUGCTQ9HAC7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SUGCTQ9HAC7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SUGCTQ9HAC7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SUGCTQ9HAC7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SUGCTQ9HAC7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms