Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCLRE1BQ9H816 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCLRE1BQ9H816 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCLRE1BQ9H816 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCLRE1BQ9H816 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCLRE1BQ9H816 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCLRE1BQ9H816 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCLRE1BQ9H816 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCLRE1BQ9H816 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCLRE1BQ9H816 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCLRE1BQ9H816 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCLRE1BQ9H816 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCLRE1BQ9H816 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DCLRE1BQ9H816 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCLRE1BQ9H816 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCLRE1BQ9H816 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DCLRE1BQ9H816 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCLRE1BQ9H816 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCLRE1BQ9H816 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCLRE1BQ9H816 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCLRE1BQ9H816 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCLRE1BQ9H816 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCLRE1BQ9H816 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCLRE1BQ9H816 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCLRE1BQ9H816 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCLRE1BQ9H816 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCLRE1BQ9H816 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCLRE1BQ9H816 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCLRE1BQ9H816 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCLRE1BQ9H816 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCLRE1BQ9H816 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCLRE1BQ9H816 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCLRE1BQ9H816 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCLRE1BQ9H816 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCLRE1BQ9H816 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCLRE1BQ9H816 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCLRE1BQ9H816 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCLRE1BQ9H816 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCLRE1BQ9H816 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCLRE1BQ9H816 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCLRE1BQ9H816 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCLRE1BQ9H816 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCLRE1BQ9H816 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCLRE1BQ9H816 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCLRE1BQ9H816 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCLRE1BQ9H816 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCLRE1BQ9H816 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCLRE1BQ9H816 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCLRE1BQ9H816 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCLRE1BQ9H816 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCLRE1BQ9H816 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCLRE1BQ9H816 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCLRE1BQ9H816 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DCLRE1BQ9H816 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCLRE1BQ9H816 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCLRE1BQ9H816 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCLRE1BQ9H816 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCLRE1BQ9H816 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCLRE1BQ9H816 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCLRE1BQ9H816 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCLRE1BQ9H816 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCLRE1BQ9H816 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DCLRE1BQ9H816 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DCLRE1BQ9H816 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DCLRE1BQ9H816 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCLRE1BQ9H816 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCLRE1BQ9H816 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCLRE1BQ9H816 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCLRE1BQ9H816 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCLRE1BQ9H816 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCLRE1BQ9H816 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCLRE1BQ9H816 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCLRE1BQ9H816 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCLRE1BQ9H816 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCLRE1BQ9H816 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCLRE1BQ9H816 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCLRE1BQ9H816 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCLRE1BQ9H816 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCLRE1BQ9H816 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCLRE1BQ9H816 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCLRE1BQ9H816 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCLRE1BQ9H816 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCLRE1BQ9H816 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCLRE1BQ9H816 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCLRE1BQ9H816 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCLRE1BQ9H816 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCLRE1BQ9H816 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCLRE1BQ9H816 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCLRE1BQ9H816 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCLRE1BQ9H816 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DCLRE1BQ9H816 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCLRE1BQ9H816 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCLRE1BQ9H816 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCLRE1BQ9H816 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCLRE1BQ9H816 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCLRE1BQ9H816 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCLRE1BQ9H816 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCLRE1BQ9H816 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCLRE1BQ9H816 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCLRE1BQ9H816 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms