Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6S0

YTHDC2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC2Q9H6S0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
YTHDC2Q9H6S0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
YTHDC2Q9H6S0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
YTHDC2Q9H6S0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
YTHDC2Q9H6S0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
YTHDC2Q9H6S0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
YTHDC2Q9H6S0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
YTHDC2Q9H6S0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
YTHDC2Q9H6S0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
YTHDC2Q9H6S0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
YTHDC2Q9H6S0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
YTHDC2Q9H6S0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
YTHDC2Q9H6S0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
YTHDC2Q9H6S0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
YTHDC2Q9H6S0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
YTHDC2Q9H6S0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
YTHDC2Q9H6S0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
YTHDC2Q9H6S0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
YTHDC2Q9H6S0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
YTHDC2Q9H6S0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
YTHDC2Q9H6S0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
YTHDC2Q9H6S0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
YTHDC2Q9H6S0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
YTHDC2Q9H6S0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
YTHDC2Q9H6S0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
YTHDC2Q9H6S0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
YTHDC2Q9H6S0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
YTHDC2Q9H6S0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
YTHDC2Q9H6S0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
YTHDC2Q9H6S0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
YTHDC2Q9H6S0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
YTHDC2Q9H6S0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
YTHDC2Q9H6S0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
YTHDC2Q9H6S0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
YTHDC2Q9H6S0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
YTHDC2Q9H6S0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
YTHDC2Q9H6S0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
YTHDC2Q9H6S0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
YTHDC2Q9H6S0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
YTHDC2Q9H6S0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
YTHDC2Q9H6S0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
YTHDC2Q9H6S0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
YTHDC2Q9H6S0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
YTHDC2Q9H6S0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
YTHDC2Q9H6S0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
YTHDC2Q9H6S0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
YTHDC2Q9H6S0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
YTHDC2Q9H6S0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
YTHDC2Q9H6S0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
YTHDC2Q9H6S0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
YTHDC2Q9H6S0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
YTHDC2Q9H6S0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
YTHDC2Q9H6S0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
YTHDC2Q9H6S0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
YTHDC2Q9H6S0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
YTHDC2Q9H6S0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.34
YTHDC2Q9H6S0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
YTHDC2Q9H6S0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
YTHDC2Q9H6S0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
YTHDC2Q9H6S0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
YTHDC2Q9H6S0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
YTHDC2Q9H6S0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
YTHDC2Q9H6S0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
YTHDC2Q9H6S0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
YTHDC2Q9H6S0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
YTHDC2Q9H6S0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
YTHDC2Q9H6S0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
YTHDC2Q9H6S0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
YTHDC2Q9H6S0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
YTHDC2Q9H6S0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
YTHDC2Q9H6S0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
YTHDC2Q9H6S0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
YTHDC2Q9H6S0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
YTHDC2Q9H6S0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
YTHDC2Q9H6S0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
YTHDC2Q9H6S0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
YTHDC2Q9H6S0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
YTHDC2Q9H6S0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
YTHDC2Q9H6S0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
YTHDC2Q9H6S0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
YTHDC2Q9H6S0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
YTHDC2Q9H6S0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
YTHDC2Q9H6S0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
YTHDC2Q9H6S0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
YTHDC2Q9H6S0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
YTHDC2Q9H6S0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.33
YTHDC2Q9H6S0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
YTHDC2Q9H6S0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
YTHDC2Q9H6S0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
YTHDC2Q9H6S0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
YTHDC2Q9H6S0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
YTHDC2Q9H6S0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
YTHDC2Q9H6S0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
YTHDC2Q9H6S0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
YTHDC2Q9H6S0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
YTHDC2Q9H6S0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
YTHDC2Q9H6S0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
YTHDC2Q9H6S0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
YTHDC2Q9H6S0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
YTHDC2Q9H6S0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms