Protein–RNA interactions for Protein: Q9H270

VPS11, Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS11Q9H270 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS11Q9H270 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS11Q9H270 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS11Q9H270 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS11Q9H270 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS11Q9H270 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS11Q9H270 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS11Q9H270 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS11Q9H270 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS11Q9H270 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS11Q9H270 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS11Q9H270 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS11Q9H270 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS11Q9H270 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS11Q9H270 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS11Q9H270 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS11Q9H270 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS11Q9H270 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS11Q9H270 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS11Q9H270 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS11Q9H270 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS11Q9H270 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VPS11Q9H270 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
VPS11Q9H270 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VPS11Q9H270 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS11Q9H270 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS11Q9H270 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS11Q9H270 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS11Q9H270 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS11Q9H270 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS11Q9H270 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS11Q9H270 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS11Q9H270 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS11Q9H270 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS11Q9H270 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS11Q9H270 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS11Q9H270 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS11Q9H270 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS11Q9H270 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS11Q9H270 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS11Q9H270 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS11Q9H270 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS11Q9H270 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS11Q9H270 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS11Q9H270 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS11Q9H270 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS11Q9H270 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS11Q9H270 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
VPS11Q9H270 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS11Q9H270 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS11Q9H270 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS11Q9H270 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS11Q9H270 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS11Q9H270 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS11Q9H270 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS11Q9H270 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS11Q9H270 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS11Q9H270 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS11Q9H270 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS11Q9H270 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS11Q9H270 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS11Q9H270 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS11Q9H270 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS11Q9H270 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS11Q9H270 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS11Q9H270 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS11Q9H270 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS11Q9H270 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS11Q9H270 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS11Q9H270 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS11Q9H270 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS11Q9H270 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS11Q9H270 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS11Q9H270 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS11Q9H270 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS11Q9H270 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS11Q9H270 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS11Q9H270 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS11Q9H270 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS11Q9H270 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS11Q9H270 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS11Q9H270 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS11Q9H270 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS11Q9H270 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS11Q9H270 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS11Q9H270 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS11Q9H270 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS11Q9H270 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS11Q9H270 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS11Q9H270 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS11Q9H270 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS11Q9H270 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS11Q9H270 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS11Q9H270 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS11Q9H270 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS11Q9H270 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS11Q9H270 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VPS11Q9H270 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VPS11Q9H270 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS11Q9H270 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms