Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNHG12Q9BXW3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNHG12Q9BXW3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNHG12Q9BXW3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNHG12Q9BXW3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SNHG12Q9BXW3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNHG12Q9BXW3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNHG12Q9BXW3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SNHG12Q9BXW3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNHG12Q9BXW3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNHG12Q9BXW3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNHG12Q9BXW3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNHG12Q9BXW3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNHG12Q9BXW3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNHG12Q9BXW3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNHG12Q9BXW3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNHG12Q9BXW3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNHG12Q9BXW3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SNHG12Q9BXW3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNHG12Q9BXW3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNHG12Q9BXW3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNHG12Q9BXW3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNHG12Q9BXW3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNHG12Q9BXW3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNHG12Q9BXW3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNHG12Q9BXW3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNHG12Q9BXW3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNHG12Q9BXW3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNHG12Q9BXW3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNHG12Q9BXW3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNHG12Q9BXW3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNHG12Q9BXW3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNHG12Q9BXW3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNHG12Q9BXW3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNHG12Q9BXW3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNHG12Q9BXW3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNHG12Q9BXW3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNHG12Q9BXW3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNHG12Q9BXW3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNHG12Q9BXW3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNHG12Q9BXW3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNHG12Q9BXW3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNHG12Q9BXW3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNHG12Q9BXW3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNHG12Q9BXW3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNHG12Q9BXW3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNHG12Q9BXW3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNHG12Q9BXW3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNHG12Q9BXW3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNHG12Q9BXW3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNHG12Q9BXW3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNHG12Q9BXW3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNHG12Q9BXW3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNHG12Q9BXW3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNHG12Q9BXW3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNHG12Q9BXW3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNHG12Q9BXW3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNHG12Q9BXW3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNHG12Q9BXW3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNHG12Q9BXW3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNHG12Q9BXW3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNHG12Q9BXW3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNHG12Q9BXW3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNHG12Q9BXW3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNHG12Q9BXW3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNHG12Q9BXW3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNHG12Q9BXW3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNHG12Q9BXW3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNHG12Q9BXW3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNHG12Q9BXW3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNHG12Q9BXW3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNHG12Q9BXW3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNHG12Q9BXW3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNHG12Q9BXW3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNHG12Q9BXW3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNHG12Q9BXW3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNHG12Q9BXW3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNHG12Q9BXW3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNHG12Q9BXW3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNHG12Q9BXW3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNHG12Q9BXW3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNHG12Q9BXW3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNHG12Q9BXW3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNHG12Q9BXW3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNHG12Q9BXW3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNHG12Q9BXW3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNHG12Q9BXW3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNHG12Q9BXW3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNHG12Q9BXW3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNHG12Q9BXW3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNHG12Q9BXW3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNHG12Q9BXW3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNHG12Q9BXW3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNHG12Q9BXW3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNHG12Q9BXW3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNHG12Q9BXW3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNHG12Q9BXW3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNHG12Q9BXW3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms