Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM208Q9BTX3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM208Q9BTX3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM208Q9BTX3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM208Q9BTX3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM208Q9BTX3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM208Q9BTX3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM208Q9BTX3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM208Q9BTX3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM208Q9BTX3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM208Q9BTX3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM208Q9BTX3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM208Q9BTX3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM208Q9BTX3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM208Q9BTX3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM208Q9BTX3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM208Q9BTX3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM208Q9BTX3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM208Q9BTX3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM208Q9BTX3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM208Q9BTX3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM208Q9BTX3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM208Q9BTX3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM208Q9BTX3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM208Q9BTX3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM208Q9BTX3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM208Q9BTX3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM208Q9BTX3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM208Q9BTX3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM208Q9BTX3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM208Q9BTX3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM208Q9BTX3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM208Q9BTX3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM208Q9BTX3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM208Q9BTX3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM208Q9BTX3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM208Q9BTX3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM208Q9BTX3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM208Q9BTX3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM208Q9BTX3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM208Q9BTX3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM208Q9BTX3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM208Q9BTX3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM208Q9BTX3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM208Q9BTX3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM208Q9BTX3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM208Q9BTX3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM208Q9BTX3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM208Q9BTX3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM208Q9BTX3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM208Q9BTX3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM208Q9BTX3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM208Q9BTX3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM208Q9BTX3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM208Q9BTX3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM208Q9BTX3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM208Q9BTX3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM208Q9BTX3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM208Q9BTX3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM208Q9BTX3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM208Q9BTX3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM208Q9BTX3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM208Q9BTX3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM208Q9BTX3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM208Q9BTX3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM208Q9BTX3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM208Q9BTX3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM208Q9BTX3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM208Q9BTX3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM208Q9BTX3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM208Q9BTX3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM208Q9BTX3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM208Q9BTX3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM208Q9BTX3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM208Q9BTX3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms