Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAD9AQ99638 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAD9AQ99638 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAD9AQ99638 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RAD9AQ99638 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAD9AQ99638 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAD9AQ99638 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAD9AQ99638 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAD9AQ99638 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAD9AQ99638 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAD9AQ99638 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAD9AQ99638 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAD9AQ99638 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAD9AQ99638 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAD9AQ99638 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAD9AQ99638 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAD9AQ99638 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAD9AQ99638 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAD9AQ99638 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAD9AQ99638 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAD9AQ99638 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAD9AQ99638 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAD9AQ99638 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAD9AQ99638 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAD9AQ99638 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAD9AQ99638 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAD9AQ99638 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAD9AQ99638 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAD9AQ99638 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAD9AQ99638 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RAD9AQ99638 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAD9AQ99638 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAD9AQ99638 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAD9AQ99638 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
RAD9AQ99638 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAD9AQ99638 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAD9AQ99638 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RAD9AQ99638 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAD9AQ99638 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RAD9AQ99638 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
RAD9AQ99638 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAD9AQ99638 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAD9AQ99638 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAD9AQ99638 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAD9AQ99638 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAD9AQ99638 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RAD9AQ99638 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RAD9AQ99638 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
RAD9AQ99638 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAD9AQ99638 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAD9AQ99638 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAD9AQ99638 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAD9AQ99638 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAD9AQ99638 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAD9AQ99638 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAD9AQ99638 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAD9AQ99638 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAD9AQ99638 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAD9AQ99638 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAD9AQ99638 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RAD9AQ99638 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAD9AQ99638 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAD9AQ99638 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAD9AQ99638 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAD9AQ99638 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAD9AQ99638 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAD9AQ99638 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAD9AQ99638 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAD9AQ99638 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAD9AQ99638 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RAD9AQ99638 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAD9AQ99638 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAD9AQ99638 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RAD9AQ99638 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAD9AQ99638 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RAD9AQ99638 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RAD9AQ99638 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAD9AQ99638 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAD9AQ99638 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAD9AQ99638 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAD9AQ99638 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAD9AQ99638 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAD9AQ99638 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAD9AQ99638 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAD9AQ99638 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAD9AQ99638 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAD9AQ99638 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAD9AQ99638 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAD9AQ99638 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAD9AQ99638 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RAD9AQ99638 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAD9AQ99638 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAD9AQ99638 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAD9AQ99638 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RAD9AQ99638 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RAD9AQ99638 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAD9AQ99638 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAD9AQ99638 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RAD9AQ99638 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAD9AQ99638 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms