Protein–RNA interactions for Protein: Q99608

NDN, Necdin, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNQ99608 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NDNQ99608 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDNQ99608 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDNQ99608 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDNQ99608 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDNQ99608 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDNQ99608 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDNQ99608 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDNQ99608 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NDNQ99608 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NDNQ99608 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NDNQ99608 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NDNQ99608 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NDNQ99608 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NDNQ99608 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDNQ99608 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDNQ99608 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDNQ99608 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDNQ99608 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDNQ99608 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDNQ99608 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDNQ99608 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDNQ99608 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDNQ99608 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NDNQ99608 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDNQ99608 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDNQ99608 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDNQ99608 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDNQ99608 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NDNQ99608 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDNQ99608 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDNQ99608 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDNQ99608 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NDNQ99608 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NDNQ99608 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NDNQ99608 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDNQ99608 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDNQ99608 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDNQ99608 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDNQ99608 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDNQ99608 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDNQ99608 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDNQ99608 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDNQ99608 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDNQ99608 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDNQ99608 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDNQ99608 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDNQ99608 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDNQ99608 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NDNQ99608 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NDNQ99608 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NDNQ99608 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NDNQ99608 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NDNQ99608 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NDNQ99608 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NDNQ99608 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDNQ99608 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDNQ99608 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDNQ99608 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDNQ99608 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDNQ99608 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDNQ99608 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDNQ99608 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NDNQ99608 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NDNQ99608 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NDNQ99608 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NDNQ99608 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NDNQ99608 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NDNQ99608 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NDNQ99608 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDNQ99608 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDNQ99608 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDNQ99608 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDNQ99608 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NDNQ99608 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NDNQ99608 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NDNQ99608 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDNQ99608 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDNQ99608 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDNQ99608 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDNQ99608 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NDNQ99608 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDNQ99608 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDNQ99608 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDNQ99608 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDNQ99608 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDNQ99608 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDNQ99608 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDNQ99608 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDNQ99608 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDNQ99608 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDNQ99608 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDNQ99608 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDNQ99608 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDNQ99608 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDNQ99608 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDNQ99608 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDNQ99608 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDNQ99608 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDNQ99608 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.7 ms