Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST8

CEP89, Centrosomal protein of 89 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP89Q96ST8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CEP89Q96ST8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP89Q96ST8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP89Q96ST8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP89Q96ST8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CEP89Q96ST8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CEP89Q96ST8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CEP89Q96ST8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CEP89Q96ST8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CEP89Q96ST8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CEP89Q96ST8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CEP89Q96ST8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CEP89Q96ST8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP89Q96ST8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP89Q96ST8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP89Q96ST8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP89Q96ST8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP89Q96ST8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP89Q96ST8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP89Q96ST8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP89Q96ST8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP89Q96ST8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP89Q96ST8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP89Q96ST8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP89Q96ST8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP89Q96ST8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP89Q96ST8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP89Q96ST8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CEP89Q96ST8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CEP89Q96ST8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CEP89Q96ST8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CEP89Q96ST8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CEP89Q96ST8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CEP89Q96ST8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CEP89Q96ST8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP89Q96ST8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP89Q96ST8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP89Q96ST8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP89Q96ST8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP89Q96ST8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP89Q96ST8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP89Q96ST8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP89Q96ST8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP89Q96ST8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP89Q96ST8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP89Q96ST8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP89Q96ST8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP89Q96ST8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP89Q96ST8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP89Q96ST8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP89Q96ST8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP89Q96ST8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP89Q96ST8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CEP89Q96ST8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP89Q96ST8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP89Q96ST8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP89Q96ST8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP89Q96ST8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP89Q96ST8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP89Q96ST8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP89Q96ST8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP89Q96ST8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP89Q96ST8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP89Q96ST8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP89Q96ST8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP89Q96ST8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP89Q96ST8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP89Q96ST8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP89Q96ST8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP89Q96ST8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP89Q96ST8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP89Q96ST8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP89Q96ST8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP89Q96ST8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP89Q96ST8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP89Q96ST8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP89Q96ST8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP89Q96ST8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP89Q96ST8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP89Q96ST8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP89Q96ST8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP89Q96ST8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP89Q96ST8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP89Q96ST8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP89Q96ST8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP89Q96ST8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP89Q96ST8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP89Q96ST8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP89Q96ST8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP89Q96ST8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP89Q96ST8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP89Q96ST8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CEP89Q96ST8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CEP89Q96ST8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CEP89Q96ST8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP89Q96ST8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP89Q96ST8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP89Q96ST8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CEP89Q96ST8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CEP89Q96ST8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms