Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK4

BBS4, Bardet-Biedl syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS4Q96RK4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBS4Q96RK4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBS4Q96RK4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBS4Q96RK4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBS4Q96RK4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBS4Q96RK4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBS4Q96RK4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBS4Q96RK4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBS4Q96RK4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBS4Q96RK4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBS4Q96RK4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BBS4Q96RK4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBS4Q96RK4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBS4Q96RK4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBS4Q96RK4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBS4Q96RK4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBS4Q96RK4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBS4Q96RK4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS4Q96RK4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS4Q96RK4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS4Q96RK4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS4Q96RK4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS4Q96RK4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BBS4Q96RK4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BBS4Q96RK4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BBS4Q96RK4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBS4Q96RK4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBS4Q96RK4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBS4Q96RK4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BBS4Q96RK4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BBS4Q96RK4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BBS4Q96RK4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BBS4Q96RK4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BBS4Q96RK4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BBS4Q96RK4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BBS4Q96RK4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BBS4Q96RK4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BBS4Q96RK4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BBS4Q96RK4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BBS4Q96RK4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS4Q96RK4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS4Q96RK4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS4Q96RK4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS4Q96RK4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS4Q96RK4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS4Q96RK4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BBS4Q96RK4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BBS4Q96RK4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BBS4Q96RK4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BBS4Q96RK4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BBS4Q96RK4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BBS4Q96RK4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BBS4Q96RK4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BBS4Q96RK4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BBS4Q96RK4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BBS4Q96RK4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BBS4Q96RK4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BBS4Q96RK4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBS4Q96RK4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBS4Q96RK4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBS4Q96RK4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBS4Q96RK4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBS4Q96RK4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBS4Q96RK4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BBS4Q96RK4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BBS4Q96RK4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBS4Q96RK4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBS4Q96RK4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBS4Q96RK4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBS4Q96RK4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBS4Q96RK4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBS4Q96RK4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBS4Q96RK4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBS4Q96RK4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBS4Q96RK4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBS4Q96RK4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBS4Q96RK4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBS4Q96RK4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBS4Q96RK4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBS4Q96RK4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBS4Q96RK4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBS4Q96RK4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBS4Q96RK4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBS4Q96RK4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BBS4Q96RK4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBS4Q96RK4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBS4Q96RK4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBS4Q96RK4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
BBS4Q96RK4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BBS4Q96RK4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBS4Q96RK4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBS4Q96RK4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBS4Q96RK4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BBS4Q96RK4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BBS4Q96RK4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BBS4Q96RK4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BBS4Q96RK4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BBS4Q96RK4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BBS4Q96RK4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BBS4Q96RK4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms