Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX18Q96RF0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX18Q96RF0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX18Q96RF0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX18Q96RF0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX18Q96RF0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX18Q96RF0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX18Q96RF0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX18Q96RF0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX18Q96RF0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX18Q96RF0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX18Q96RF0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX18Q96RF0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX18Q96RF0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX18Q96RF0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX18Q96RF0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX18Q96RF0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX18Q96RF0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX18Q96RF0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX18Q96RF0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX18Q96RF0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX18Q96RF0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX18Q96RF0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX18Q96RF0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX18Q96RF0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX18Q96RF0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX18Q96RF0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX18Q96RF0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX18Q96RF0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX18Q96RF0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX18Q96RF0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX18Q96RF0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX18Q96RF0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX18Q96RF0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX18Q96RF0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX18Q96RF0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX18Q96RF0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX18Q96RF0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX18Q96RF0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX18Q96RF0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX18Q96RF0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX18Q96RF0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX18Q96RF0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX18Q96RF0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX18Q96RF0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX18Q96RF0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX18Q96RF0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX18Q96RF0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX18Q96RF0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX18Q96RF0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX18Q96RF0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX18Q96RF0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX18Q96RF0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX18Q96RF0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX18Q96RF0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX18Q96RF0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX18Q96RF0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX18Q96RF0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX18Q96RF0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX18Q96RF0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX18Q96RF0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX18Q96RF0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX18Q96RF0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX18Q96RF0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX18Q96RF0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX18Q96RF0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX18Q96RF0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX18Q96RF0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX18Q96RF0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms