Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ARXQ96QS3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ARXQ96QS3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ARXQ96QS3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ARXQ96QS3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ARXQ96QS3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ARXQ96QS3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ARXQ96QS3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ARXQ96QS3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ARXQ96QS3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ARXQ96QS3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ARXQ96QS3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ARXQ96QS3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ARXQ96QS3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ARXQ96QS3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ARXQ96QS3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ARXQ96QS3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
ARXQ96QS3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ARXQ96QS3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ARXQ96QS3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
ARXQ96QS3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ARXQ96QS3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
ARXQ96QS3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ARXQ96QS3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ARXQ96QS3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ARXQ96QS3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ARXQ96QS3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ARXQ96QS3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ARXQ96QS3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ARXQ96QS3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ARXQ96QS3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ARXQ96QS3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ARXQ96QS3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ARXQ96QS3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ARXQ96QS3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
ARXQ96QS3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
ARXQ96QS3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ARXQ96QS3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ARXQ96QS3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
ARXQ96QS3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33■■■□□ 2.87
ARXQ96QS3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ARXQ96QS3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ARXQ96QS3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ARXQ96QS3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ARXQ96QS3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ARXQ96QS3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ARXQ96QS3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ARXQ96QS3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
ARXQ96QS3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ARXQ96QS3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ARXQ96QS3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ARXQ96QS3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ARXQ96QS3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ARXQ96QS3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ARXQ96QS3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ARXQ96QS3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ARXQ96QS3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ARXQ96QS3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ARXQ96QS3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ARXQ96QS3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
ARXQ96QS3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ARXQ96QS3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ARXQ96QS3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ARXQ96QS3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ARXQ96QS3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ARXQ96QS3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
ARXQ96QS3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ARXQ96QS3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ARXQ96QS3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ARXQ96QS3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ARXQ96QS3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ARXQ96QS3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ARXQ96QS3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ARXQ96QS3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ARXQ96QS3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ARXQ96QS3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ARXQ96QS3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ARXQ96QS3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ARXQ96QS3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
ARXQ96QS3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ARXQ96QS3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ARXQ96QS3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ARXQ96QS3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ARXQ96QS3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ARXQ96QS3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ARXQ96QS3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
ARXQ96QS3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ARXQ96QS3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ARXQ96QS3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ARXQ96QS3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ARXQ96QS3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ARXQ96QS3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ARXQ96QS3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ARXQ96QS3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ARXQ96QS3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ARXQ96QS3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ARXQ96QS3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ARXQ96QS3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ARXQ96QS3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ARXQ96QS3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms