Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SAMD11Q96NU1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SAMD11Q96NU1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SAMD11Q96NU1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SAMD11Q96NU1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SAMD11Q96NU1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SAMD11Q96NU1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SAMD11Q96NU1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SAMD11Q96NU1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SAMD11Q96NU1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SAMD11Q96NU1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SAMD11Q96NU1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SAMD11Q96NU1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMD11Q96NU1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMD11Q96NU1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMD11Q96NU1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMD11Q96NU1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMD11Q96NU1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMD11Q96NU1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMD11Q96NU1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMD11Q96NU1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMD11Q96NU1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SAMD11Q96NU1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SAMD11Q96NU1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SAMD11Q96NU1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SAMD11Q96NU1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SAMD11Q96NU1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SAMD11Q96NU1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SAMD11Q96NU1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SAMD11Q96NU1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SAMD11Q96NU1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SAMD11Q96NU1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SAMD11Q96NU1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SAMD11Q96NU1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SAMD11Q96NU1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SAMD11Q96NU1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SAMD11Q96NU1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SAMD11Q96NU1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SAMD11Q96NU1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SAMD11Q96NU1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SAMD11Q96NU1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SAMD11Q96NU1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SAMD11Q96NU1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SAMD11Q96NU1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SAMD11Q96NU1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SAMD11Q96NU1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SAMD11Q96NU1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SAMD11Q96NU1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SAMD11Q96NU1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SAMD11Q96NU1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SAMD11Q96NU1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SAMD11Q96NU1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SAMD11Q96NU1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SAMD11Q96NU1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SAMD11Q96NU1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SAMD11Q96NU1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SAMD11Q96NU1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SAMD11Q96NU1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SAMD11Q96NU1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SAMD11Q96NU1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD11Q96NU1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD11Q96NU1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD11Q96NU1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD11Q96NU1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD11Q96NU1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD11Q96NU1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD11Q96NU1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD11Q96NU1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SAMD11Q96NU1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SAMD11Q96NU1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SAMD11Q96NU1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SAMD11Q96NU1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMD11Q96NU1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMD11Q96NU1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMD11Q96NU1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMD11Q96NU1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMD11Q96NU1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMD11Q96NU1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMD11Q96NU1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SAMD11Q96NU1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SAMD11Q96NU1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SAMD11Q96NU1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SAMD11Q96NU1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMD11Q96NU1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMD11Q96NU1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMD11Q96NU1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMD11Q96NU1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SAMD11Q96NU1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SAMD11Q96NU1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SAMD11Q96NU1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SAMD11Q96NU1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SAMD11Q96NU1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SAMD11Q96NU1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SAMD11Q96NU1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SAMD11Q96NU1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SAMD11Q96NU1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SAMD11Q96NU1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SAMD11Q96NU1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SAMD11Q96NU1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SAMD11Q96NU1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 414.3 ms