Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC51Q96ER9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC51Q96ER9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC51Q96ER9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC51Q96ER9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC51Q96ER9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC51Q96ER9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC51Q96ER9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC51Q96ER9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC51Q96ER9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC51Q96ER9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC51Q96ER9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC51Q96ER9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC51Q96ER9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC51Q96ER9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC51Q96ER9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC51Q96ER9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC51Q96ER9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC51Q96ER9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC51Q96ER9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC51Q96ER9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC51Q96ER9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC51Q96ER9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC51Q96ER9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC51Q96ER9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC51Q96ER9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC51Q96ER9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC51Q96ER9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC51Q96ER9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC51Q96ER9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC51Q96ER9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC51Q96ER9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC51Q96ER9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC51Q96ER9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms