Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CENPTQ96BT3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CENPTQ96BT3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CENPTQ96BT3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CENPTQ96BT3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CENPTQ96BT3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CENPTQ96BT3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CENPTQ96BT3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CENPTQ96BT3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CENPTQ96BT3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPTQ96BT3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPTQ96BT3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPTQ96BT3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPTQ96BT3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CENPTQ96BT3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CENPTQ96BT3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CENPTQ96BT3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CENPTQ96BT3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CENPTQ96BT3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CENPTQ96BT3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CENPTQ96BT3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CENPTQ96BT3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPTQ96BT3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPTQ96BT3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPTQ96BT3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPTQ96BT3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPTQ96BT3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPTQ96BT3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPTQ96BT3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPTQ96BT3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPTQ96BT3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPTQ96BT3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPTQ96BT3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPTQ96BT3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPTQ96BT3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPTQ96BT3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPTQ96BT3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CENPTQ96BT3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CENPTQ96BT3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPTQ96BT3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPTQ96BT3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPTQ96BT3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPTQ96BT3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPTQ96BT3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPTQ96BT3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPTQ96BT3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPTQ96BT3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPTQ96BT3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPTQ96BT3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPTQ96BT3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPTQ96BT3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPTQ96BT3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPTQ96BT3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPTQ96BT3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPTQ96BT3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPTQ96BT3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPTQ96BT3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPTQ96BT3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPTQ96BT3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPTQ96BT3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPTQ96BT3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPTQ96BT3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPTQ96BT3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPTQ96BT3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPTQ96BT3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPTQ96BT3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPTQ96BT3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPTQ96BT3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPTQ96BT3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPTQ96BT3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPTQ96BT3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPTQ96BT3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPTQ96BT3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPTQ96BT3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPTQ96BT3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPTQ96BT3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPTQ96BT3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPTQ96BT3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPTQ96BT3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPTQ96BT3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPTQ96BT3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPTQ96BT3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPTQ96BT3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPTQ96BT3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPTQ96BT3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPTQ96BT3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPTQ96BT3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPTQ96BT3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPTQ96BT3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPTQ96BT3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPTQ96BT3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPTQ96BT3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPTQ96BT3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPTQ96BT3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPTQ96BT3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPTQ96BT3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPTQ96BT3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPTQ96BT3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPTQ96BT3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPTQ96BT3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms