Protein–RNA interactions for Protein: Q92901

RPL3L, 60S ribosomal protein L3-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3LQ92901 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL3LQ92901 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL3LQ92901 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL3LQ92901 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL3LQ92901 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL3LQ92901 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL3LQ92901 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL3LQ92901 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL3LQ92901 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL3LQ92901 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL3LQ92901 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL3LQ92901 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL3LQ92901 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL3LQ92901 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL3LQ92901 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL3LQ92901 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL3LQ92901 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL3LQ92901 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL3LQ92901 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL3LQ92901 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL3LQ92901 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL3LQ92901 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL3LQ92901 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL3LQ92901 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPL3LQ92901 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL3LQ92901 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL3LQ92901 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL3LQ92901 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL3LQ92901 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL3LQ92901 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL3LQ92901 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL3LQ92901 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL3LQ92901 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL3LQ92901 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL3LQ92901 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL3LQ92901 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL3LQ92901 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL3LQ92901 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL3LQ92901 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL3LQ92901 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL3LQ92901 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL3LQ92901 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL3LQ92901 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL3LQ92901 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL3LQ92901 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL3LQ92901 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL3LQ92901 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL3LQ92901 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL3LQ92901 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL3LQ92901 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL3LQ92901 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL3LQ92901 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL3LQ92901 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL3LQ92901 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL3LQ92901 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL3LQ92901 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL3LQ92901 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL3LQ92901 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL3LQ92901 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL3LQ92901 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL3LQ92901 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL3LQ92901 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL3LQ92901 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL3LQ92901 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL3LQ92901 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL3LQ92901 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL3LQ92901 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL3LQ92901 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL3LQ92901 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL3LQ92901 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL3LQ92901 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL3LQ92901 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL3LQ92901 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL3LQ92901 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL3LQ92901 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL3LQ92901 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL3LQ92901 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL3LQ92901 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL3LQ92901 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL3LQ92901 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL3LQ92901 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL3LQ92901 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL3LQ92901 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL3LQ92901 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL3LQ92901 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL3LQ92901 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL3LQ92901 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL3LQ92901 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL3LQ92901 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL3LQ92901 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL3LQ92901 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL3LQ92901 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL3LQ92901 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL3LQ92901 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL3LQ92901 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL3LQ92901 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL3LQ92901 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL3LQ92901 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL3LQ92901 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL3LQ92901 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms