Protein–RNA interactions for Protein: Q92600

CNOT9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT9Q92600 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT9Q92600 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNOT9Q92600 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT9Q92600 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT9Q92600 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT9Q92600 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT9Q92600 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNOT9Q92600 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNOT9Q92600 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNOT9Q92600 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNOT9Q92600 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT9Q92600 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT9Q92600 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT9Q92600 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT9Q92600 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT9Q92600 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT9Q92600 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT9Q92600 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT9Q92600 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT9Q92600 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT9Q92600 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT9Q92600 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT9Q92600 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT9Q92600 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT9Q92600 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT9Q92600 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT9Q92600 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT9Q92600 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT9Q92600 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT9Q92600 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT9Q92600 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT9Q92600 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT9Q92600 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT9Q92600 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT9Q92600 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT9Q92600 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT9Q92600 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT9Q92600 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT9Q92600 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT9Q92600 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT9Q92600 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT9Q92600 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT9Q92600 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT9Q92600 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT9Q92600 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT9Q92600 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT9Q92600 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT9Q92600 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT9Q92600 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT9Q92600 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT9Q92600 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT9Q92600 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT9Q92600 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT9Q92600 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT9Q92600 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT9Q92600 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT9Q92600 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT9Q92600 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT9Q92600 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT9Q92600 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT9Q92600 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT9Q92600 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT9Q92600 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT9Q92600 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT9Q92600 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT9Q92600 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT9Q92600 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT9Q92600 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT9Q92600 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT9Q92600 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT9Q92600 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT9Q92600 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT9Q92600 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT9Q92600 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT9Q92600 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT9Q92600 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT9Q92600 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT9Q92600 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT9Q92600 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT9Q92600 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT9Q92600 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT9Q92600 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT9Q92600 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT9Q92600 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT9Q92600 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT9Q92600 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT9Q92600 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT9Q92600 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT9Q92600 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT9Q92600 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT9Q92600 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT9Q92600 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT9Q92600 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT9Q92600 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT9Q92600 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT9Q92600 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT9Q92600 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT9Q92600 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT9Q92600 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT9Q92600 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms