Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI22

MCFD2, Multiple coagulation factor deficiency protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCFD2Q8NI22 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCFD2Q8NI22 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCFD2Q8NI22 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCFD2Q8NI22 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCFD2Q8NI22 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCFD2Q8NI22 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCFD2Q8NI22 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCFD2Q8NI22 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCFD2Q8NI22 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCFD2Q8NI22 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCFD2Q8NI22 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCFD2Q8NI22 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCFD2Q8NI22 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCFD2Q8NI22 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCFD2Q8NI22 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCFD2Q8NI22 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCFD2Q8NI22 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCFD2Q8NI22 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCFD2Q8NI22 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCFD2Q8NI22 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCFD2Q8NI22 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCFD2Q8NI22 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCFD2Q8NI22 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCFD2Q8NI22 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCFD2Q8NI22 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCFD2Q8NI22 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCFD2Q8NI22 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCFD2Q8NI22 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCFD2Q8NI22 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCFD2Q8NI22 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCFD2Q8NI22 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCFD2Q8NI22 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCFD2Q8NI22 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCFD2Q8NI22 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCFD2Q8NI22 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCFD2Q8NI22 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCFD2Q8NI22 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCFD2Q8NI22 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCFD2Q8NI22 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCFD2Q8NI22 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCFD2Q8NI22 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCFD2Q8NI22 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCFD2Q8NI22 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MCFD2Q8NI22 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCFD2Q8NI22 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCFD2Q8NI22 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCFD2Q8NI22 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCFD2Q8NI22 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCFD2Q8NI22 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCFD2Q8NI22 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCFD2Q8NI22 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCFD2Q8NI22 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCFD2Q8NI22 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCFD2Q8NI22 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCFD2Q8NI22 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCFD2Q8NI22 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCFD2Q8NI22 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCFD2Q8NI22 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCFD2Q8NI22 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCFD2Q8NI22 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCFD2Q8NI22 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCFD2Q8NI22 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MCFD2Q8NI22 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MCFD2Q8NI22 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCFD2Q8NI22 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCFD2Q8NI22 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCFD2Q8NI22 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCFD2Q8NI22 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCFD2Q8NI22 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCFD2Q8NI22 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCFD2Q8NI22 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCFD2Q8NI22 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCFD2Q8NI22 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCFD2Q8NI22 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCFD2Q8NI22 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCFD2Q8NI22 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCFD2Q8NI22 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCFD2Q8NI22 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCFD2Q8NI22 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCFD2Q8NI22 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCFD2Q8NI22 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCFD2Q8NI22 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCFD2Q8NI22 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCFD2Q8NI22 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCFD2Q8NI22 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCFD2Q8NI22 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCFD2Q8NI22 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCFD2Q8NI22 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCFD2Q8NI22 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCFD2Q8NI22 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCFD2Q8NI22 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCFD2Q8NI22 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCFD2Q8NI22 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCFD2Q8NI22 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCFD2Q8NI22 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCFD2Q8NI22 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCFD2Q8NI22 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCFD2Q8NI22 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCFD2Q8NI22 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCFD2Q8NI22 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms