Protein–RNA interactions for Protein: Q8NER5

ACVR1C, Activin receptor type-1C, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1CQ8NER5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACVR1CQ8NER5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACVR1CQ8NER5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACVR1CQ8NER5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ACVR1CQ8NER5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACVR1CQ8NER5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACVR1CQ8NER5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACVR1CQ8NER5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACVR1CQ8NER5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACVR1CQ8NER5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACVR1CQ8NER5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACVR1CQ8NER5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACVR1CQ8NER5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACVR1CQ8NER5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACVR1CQ8NER5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACVR1CQ8NER5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACVR1CQ8NER5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACVR1CQ8NER5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACVR1CQ8NER5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACVR1CQ8NER5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACVR1CQ8NER5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACVR1CQ8NER5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACVR1CQ8NER5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACVR1CQ8NER5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACVR1CQ8NER5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACVR1CQ8NER5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACVR1CQ8NER5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACVR1CQ8NER5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACVR1CQ8NER5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ACVR1CQ8NER5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACVR1CQ8NER5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACVR1CQ8NER5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACVR1CQ8NER5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACVR1CQ8NER5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACVR1CQ8NER5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ACVR1CQ8NER5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACVR1CQ8NER5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACVR1CQ8NER5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ACVR1CQ8NER5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACVR1CQ8NER5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACVR1CQ8NER5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACVR1CQ8NER5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ACVR1CQ8NER5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACVR1CQ8NER5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACVR1CQ8NER5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACVR1CQ8NER5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACVR1CQ8NER5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACVR1CQ8NER5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACVR1CQ8NER5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACVR1CQ8NER5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACVR1CQ8NER5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACVR1CQ8NER5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACVR1CQ8NER5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACVR1CQ8NER5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACVR1CQ8NER5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACVR1CQ8NER5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACVR1CQ8NER5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACVR1CQ8NER5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACVR1CQ8NER5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ACVR1CQ8NER5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ACVR1CQ8NER5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACVR1CQ8NER5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACVR1CQ8NER5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACVR1CQ8NER5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACVR1CQ8NER5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACVR1CQ8NER5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACVR1CQ8NER5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACVR1CQ8NER5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACVR1CQ8NER5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACVR1CQ8NER5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACVR1CQ8NER5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACVR1CQ8NER5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACVR1CQ8NER5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACVR1CQ8NER5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACVR1CQ8NER5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ACVR1CQ8NER5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ACVR1CQ8NER5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACVR1CQ8NER5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACVR1CQ8NER5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACVR1CQ8NER5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACVR1CQ8NER5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACVR1CQ8NER5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACVR1CQ8NER5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACVR1CQ8NER5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACVR1CQ8NER5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACVR1CQ8NER5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACVR1CQ8NER5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACVR1CQ8NER5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACVR1CQ8NER5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACVR1CQ8NER5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACVR1CQ8NER5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACVR1CQ8NER5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACVR1CQ8NER5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACVR1CQ8NER5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACVR1CQ8NER5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACVR1CQ8NER5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACVR1CQ8NER5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACVR1CQ8NER5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ACVR1CQ8NER5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACVR1CQ8NER5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.9 ms