Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COLGALT1Q8NBJ5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
COLGALT1Q8NBJ5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COLGALT1Q8NBJ5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
COLGALT1Q8NBJ5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COLGALT1Q8NBJ5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.55■■■□□ 2
COLGALT1Q8NBJ5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
COLGALT1Q8NBJ5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
COLGALT1Q8NBJ5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COLGALT1Q8NBJ5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COLGALT1Q8NBJ5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.53■■■□□ 2
COLGALT1Q8NBJ5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COLGALT1Q8NBJ5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COLGALT1Q8NBJ5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
COLGALT1Q8NBJ5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COLGALT1Q8NBJ5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COLGALT1Q8NBJ5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COLGALT1Q8NBJ5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COLGALT1Q8NBJ5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COLGALT1Q8NBJ5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
COLGALT1Q8NBJ5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COLGALT1Q8NBJ5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COLGALT1Q8NBJ5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
COLGALT1Q8NBJ5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
COLGALT1Q8NBJ5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COLGALT1Q8NBJ5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COLGALT1Q8NBJ5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COLGALT1Q8NBJ5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COLGALT1Q8NBJ5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COLGALT1Q8NBJ5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COLGALT1Q8NBJ5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
COLGALT1Q8NBJ5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COLGALT1Q8NBJ5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COLGALT1Q8NBJ5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COLGALT1Q8NBJ5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COLGALT1Q8NBJ5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COLGALT1Q8NBJ5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COLGALT1Q8NBJ5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COLGALT1Q8NBJ5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COLGALT1Q8NBJ5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COLGALT1Q8NBJ5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
COLGALT1Q8NBJ5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COLGALT1Q8NBJ5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COLGALT1Q8NBJ5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COLGALT1Q8NBJ5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COLGALT1Q8NBJ5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COLGALT1Q8NBJ5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COLGALT1Q8NBJ5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COLGALT1Q8NBJ5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COLGALT1Q8NBJ5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COLGALT1Q8NBJ5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COLGALT1Q8NBJ5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COLGALT1Q8NBJ5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COLGALT1Q8NBJ5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COLGALT1Q8NBJ5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COLGALT1Q8NBJ5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COLGALT1Q8NBJ5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
COLGALT1Q8NBJ5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COLGALT1Q8NBJ5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
COLGALT1Q8NBJ5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
COLGALT1Q8NBJ5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
COLGALT1Q8NBJ5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
COLGALT1Q8NBJ5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COLGALT1Q8NBJ5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COLGALT1Q8NBJ5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COLGALT1Q8NBJ5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COLGALT1Q8NBJ5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COLGALT1Q8NBJ5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COLGALT1Q8NBJ5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COLGALT1Q8NBJ5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COLGALT1Q8NBJ5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COLGALT1Q8NBJ5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COLGALT1Q8NBJ5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COLGALT1Q8NBJ5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COLGALT1Q8NBJ5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COLGALT1Q8NBJ5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COLGALT1Q8NBJ5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COLGALT1Q8NBJ5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COLGALT1Q8NBJ5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COLGALT1Q8NBJ5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COLGALT1Q8NBJ5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COLGALT1Q8NBJ5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COLGALT1Q8NBJ5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COLGALT1Q8NBJ5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COLGALT1Q8NBJ5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COLGALT1Q8NBJ5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COLGALT1Q8NBJ5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COLGALT1Q8NBJ5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COLGALT1Q8NBJ5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COLGALT1Q8NBJ5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COLGALT1Q8NBJ5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COLGALT1Q8NBJ5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COLGALT1Q8NBJ5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COLGALT1Q8NBJ5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COLGALT1Q8NBJ5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms