Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAV1

PRPF38A, Pre-mRNA-splicing factor 38A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38AQ8NAV1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRPF38AQ8NAV1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRPF38AQ8NAV1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRPF38AQ8NAV1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRPF38AQ8NAV1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRPF38AQ8NAV1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRPF38AQ8NAV1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRPF38AQ8NAV1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRPF38AQ8NAV1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRPF38AQ8NAV1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRPF38AQ8NAV1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PRPF38AQ8NAV1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PRPF38AQ8NAV1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PRPF38AQ8NAV1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRPF38AQ8NAV1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRPF38AQ8NAV1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRPF38AQ8NAV1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRPF38AQ8NAV1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRPF38AQ8NAV1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PRPF38AQ8NAV1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRPF38AQ8NAV1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRPF38AQ8NAV1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRPF38AQ8NAV1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRPF38AQ8NAV1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRPF38AQ8NAV1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRPF38AQ8NAV1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRPF38AQ8NAV1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRPF38AQ8NAV1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRPF38AQ8NAV1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRPF38AQ8NAV1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRPF38AQ8NAV1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRPF38AQ8NAV1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRPF38AQ8NAV1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRPF38AQ8NAV1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRPF38AQ8NAV1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PRPF38AQ8NAV1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRPF38AQ8NAV1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRPF38AQ8NAV1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRPF38AQ8NAV1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRPF38AQ8NAV1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRPF38AQ8NAV1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRPF38AQ8NAV1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRPF38AQ8NAV1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRPF38AQ8NAV1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PRPF38AQ8NAV1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRPF38AQ8NAV1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PRPF38AQ8NAV1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRPF38AQ8NAV1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRPF38AQ8NAV1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRPF38AQ8NAV1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRPF38AQ8NAV1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRPF38AQ8NAV1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRPF38AQ8NAV1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PRPF38AQ8NAV1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRPF38AQ8NAV1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRPF38AQ8NAV1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRPF38AQ8NAV1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRPF38AQ8NAV1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRPF38AQ8NAV1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRPF38AQ8NAV1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRPF38AQ8NAV1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRPF38AQ8NAV1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRPF38AQ8NAV1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRPF38AQ8NAV1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRPF38AQ8NAV1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRPF38AQ8NAV1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PRPF38AQ8NAV1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRPF38AQ8NAV1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRPF38AQ8NAV1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRPF38AQ8NAV1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRPF38AQ8NAV1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PRPF38AQ8NAV1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRPF38AQ8NAV1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRPF38AQ8NAV1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRPF38AQ8NAV1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRPF38AQ8NAV1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRPF38AQ8NAV1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRPF38AQ8NAV1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRPF38AQ8NAV1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRPF38AQ8NAV1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRPF38AQ8NAV1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRPF38AQ8NAV1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRPF38AQ8NAV1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRPF38AQ8NAV1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PRPF38AQ8NAV1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRPF38AQ8NAV1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRPF38AQ8NAV1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRPF38AQ8NAV1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRPF38AQ8NAV1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRPF38AQ8NAV1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRPF38AQ8NAV1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRPF38AQ8NAV1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRPF38AQ8NAV1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRPF38AQ8NAV1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRPF38AQ8NAV1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRPF38AQ8NAV1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRPF38AQ8NAV1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRPF38AQ8NAV1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PRPF38AQ8NAV1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRPF38AQ8NAV1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms