Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8W4

PNPLA1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA1Q8N8W4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNPLA1Q8N8W4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNPLA1Q8N8W4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNPLA1Q8N8W4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PNPLA1Q8N8W4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PNPLA1Q8N8W4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PNPLA1Q8N8W4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PNPLA1Q8N8W4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNPLA1Q8N8W4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNPLA1Q8N8W4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNPLA1Q8N8W4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNPLA1Q8N8W4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNPLA1Q8N8W4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNPLA1Q8N8W4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNPLA1Q8N8W4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNPLA1Q8N8W4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNPLA1Q8N8W4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNPLA1Q8N8W4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNPLA1Q8N8W4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNPLA1Q8N8W4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNPLA1Q8N8W4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNPLA1Q8N8W4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNPLA1Q8N8W4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNPLA1Q8N8W4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNPLA1Q8N8W4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PNPLA1Q8N8W4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNPLA1Q8N8W4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNPLA1Q8N8W4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNPLA1Q8N8W4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNPLA1Q8N8W4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNPLA1Q8N8W4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNPLA1Q8N8W4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNPLA1Q8N8W4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PNPLA1Q8N8W4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PNPLA1Q8N8W4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PNPLA1Q8N8W4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNPLA1Q8N8W4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNPLA1Q8N8W4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNPLA1Q8N8W4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNPLA1Q8N8W4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PNPLA1Q8N8W4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNPLA1Q8N8W4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNPLA1Q8N8W4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PNPLA1Q8N8W4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNPLA1Q8N8W4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNPLA1Q8N8W4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNPLA1Q8N8W4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNPLA1Q8N8W4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNPLA1Q8N8W4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNPLA1Q8N8W4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNPLA1Q8N8W4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNPLA1Q8N8W4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNPLA1Q8N8W4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNPLA1Q8N8W4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNPLA1Q8N8W4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNPLA1Q8N8W4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNPLA1Q8N8W4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNPLA1Q8N8W4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNPLA1Q8N8W4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNPLA1Q8N8W4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNPLA1Q8N8W4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PNPLA1Q8N8W4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PNPLA1Q8N8W4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PNPLA1Q8N8W4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PNPLA1Q8N8W4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNPLA1Q8N8W4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNPLA1Q8N8W4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNPLA1Q8N8W4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNPLA1Q8N8W4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PNPLA1Q8N8W4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PNPLA1Q8N8W4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PNPLA1Q8N8W4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PNPLA1Q8N8W4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PNPLA1Q8N8W4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PNPLA1Q8N8W4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNPLA1Q8N8W4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNPLA1Q8N8W4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PNPLA1Q8N8W4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNPLA1Q8N8W4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNPLA1Q8N8W4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNPLA1Q8N8W4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNPLA1Q8N8W4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNPLA1Q8N8W4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNPLA1Q8N8W4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNPLA1Q8N8W4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PNPLA1Q8N8W4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PNPLA1Q8N8W4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PNPLA1Q8N8W4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNPLA1Q8N8W4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNPLA1Q8N8W4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNPLA1Q8N8W4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNPLA1Q8N8W4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PNPLA1Q8N8W4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNPLA1Q8N8W4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNPLA1Q8N8W4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PNPLA1Q8N8W4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNPLA1Q8N8W4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNPLA1Q8N8W4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PNPLA1Q8N8W4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNPLA1Q8N8W4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms